Protein–RNA interactions for Protein: Q93074

MED12, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 2,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED12Q93074 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MED12Q93074 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MED12Q93074 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MED12Q93074 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MED12Q93074 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MED12Q93074 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MED12Q93074 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MED12Q93074 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MED12Q93074 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MED12Q93074 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MED12Q93074 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MED12Q93074 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MED12Q93074 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MED12Q93074 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MED12Q93074 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MED12Q93074 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MED12Q93074 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MED12Q93074 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MED12Q93074 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MED12Q93074 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MED12Q93074 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MED12Q93074 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MED12Q93074 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MED12Q93074 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MED12Q93074 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MED12Q93074 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MED12Q93074 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MED12Q93074 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MED12Q93074 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MED12Q93074 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MED12Q93074 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MED12Q93074 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MED12Q93074 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MED12Q93074 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MED12Q93074 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MED12Q93074 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MED12Q93074 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MED12Q93074 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MED12Q93074 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MED12Q93074 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MED12Q93074 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MED12Q93074 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MED12Q93074 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MED12Q93074 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MED12Q93074 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MED12Q93074 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MED12Q93074 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MED12Q93074 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MED12Q93074 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MED12Q93074 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MED12Q93074 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MED12Q93074 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MED12Q93074 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
MED12Q93074 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MED12Q93074 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MED12Q93074 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MED12Q93074 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MED12Q93074 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MED12Q93074 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MED12Q93074 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MED12Q93074 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MED12Q93074 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MED12Q93074 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MED12Q93074 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MED12Q93074 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MED12Q93074 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MED12Q93074 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MED12Q93074 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MED12Q93074 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MED12Q93074 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MED12Q93074 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MED12Q93074 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MED12Q93074 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MED12Q93074 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MED12Q93074 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MED12Q93074 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MED12Q93074 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MED12Q93074 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MED12Q93074 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MED12Q93074 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MED12Q93074 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MED12Q93074 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MED12Q93074 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MED12Q93074 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MED12Q93074 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MED12Q93074 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MED12Q93074 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MED12Q93074 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MED12Q93074 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MED12Q93074 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MED12Q93074 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MED12Q93074 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MED12Q93074 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MED12Q93074 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MED12Q93074 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MED12Q93074 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MED12Q93074 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MED12Q93074 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MED12Q93074 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MED12Q93074 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms