Protein–RNA interactions for Protein: Q92889

ERCC4, DNA repair endonuclease XPF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC4Q92889 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ERCC4Q92889 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ERCC4Q92889 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ERCC4Q92889 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ERCC4Q92889 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ERCC4Q92889 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
ERCC4Q92889 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ERCC4Q92889 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ERCC4Q92889 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ERCC4Q92889 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ERCC4Q92889 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ERCC4Q92889 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ERCC4Q92889 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ERCC4Q92889 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ERCC4Q92889 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
ERCC4Q92889 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ERCC4Q92889 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ERCC4Q92889 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ERCC4Q92889 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ERCC4Q92889 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ERCC4Q92889 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ERCC4Q92889 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
ERCC4Q92889 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ERCC4Q92889 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ERCC4Q92889 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ERCC4Q92889 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ERCC4Q92889 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ERCC4Q92889 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ERCC4Q92889 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ERCC4Q92889 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ERCC4Q92889 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ERCC4Q92889 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ERCC4Q92889 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ERCC4Q92889 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ERCC4Q92889 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ERCC4Q92889 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ERCC4Q92889 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ERCC4Q92889 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ERCC4Q92889 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
ERCC4Q92889 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ERCC4Q92889 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ERCC4Q92889 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ERCC4Q92889 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ERCC4Q92889 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ERCC4Q92889 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ERCC4Q92889 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ERCC4Q92889 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ERCC4Q92889 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ERCC4Q92889 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ERCC4Q92889 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ERCC4Q92889 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ERCC4Q92889 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ERCC4Q92889 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ERCC4Q92889 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ERCC4Q92889 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ERCC4Q92889 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ERCC4Q92889 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ERCC4Q92889 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ERCC4Q92889 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ERCC4Q92889 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ERCC4Q92889 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ERCC4Q92889 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ERCC4Q92889 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ERCC4Q92889 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ERCC4Q92889 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ERCC4Q92889 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
ERCC4Q92889 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ERCC4Q92889 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ERCC4Q92889 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ERCC4Q92889 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ERCC4Q92889 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ERCC4Q92889 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ERCC4Q92889 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ERCC4Q92889 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ERCC4Q92889 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ERCC4Q92889 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ERCC4Q92889 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
ERCC4Q92889 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ERCC4Q92889 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ERCC4Q92889 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ERCC4Q92889 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ERCC4Q92889 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ERCC4Q92889 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ERCC4Q92889 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ERCC4Q92889 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ERCC4Q92889 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ERCC4Q92889 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ERCC4Q92889 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ERCC4Q92889 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ERCC4Q92889 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ERCC4Q92889 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ERCC4Q92889 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ERCC4Q92889 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ERCC4Q92889 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ERCC4Q92889 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ERCC4Q92889 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ERCC4Q92889 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ERCC4Q92889 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ERCC4Q92889 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ERCC4Q92889 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms