Protein–RNA interactions for Protein: Q8WY36

BBX, HMG box transcription factor BBX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBXQ8WY36 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BBXQ8WY36 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
BBXQ8WY36 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
BBXQ8WY36 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
BBXQ8WY36 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
BBXQ8WY36 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BBXQ8WY36 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BBXQ8WY36 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
BBXQ8WY36 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
BBXQ8WY36 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
BBXQ8WY36 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BBXQ8WY36 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
BBXQ8WY36 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BBXQ8WY36 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BBXQ8WY36 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
BBXQ8WY36 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
BBXQ8WY36 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
BBXQ8WY36 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BBXQ8WY36 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
BBXQ8WY36 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BBXQ8WY36 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
BBXQ8WY36 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
BBXQ8WY36 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BBXQ8WY36 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BBXQ8WY36 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BBXQ8WY36 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BBXQ8WY36 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
BBXQ8WY36 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
BBXQ8WY36 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BBXQ8WY36 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BBXQ8WY36 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BBXQ8WY36 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BBXQ8WY36 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
BBXQ8WY36 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BBXQ8WY36 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
BBXQ8WY36 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BBXQ8WY36 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
BBXQ8WY36 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BBXQ8WY36 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
BBXQ8WY36 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
BBXQ8WY36 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
BBXQ8WY36 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
BBXQ8WY36 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
BBXQ8WY36 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
BBXQ8WY36 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BBXQ8WY36 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
BBXQ8WY36 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BBXQ8WY36 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BBXQ8WY36 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
BBXQ8WY36 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BBXQ8WY36 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
BBXQ8WY36 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
BBXQ8WY36 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BBXQ8WY36 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BBXQ8WY36 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
BBXQ8WY36 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BBXQ8WY36 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BBXQ8WY36 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BBXQ8WY36 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BBXQ8WY36 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BBXQ8WY36 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BBXQ8WY36 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BBXQ8WY36 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
BBXQ8WY36 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BBXQ8WY36 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BBXQ8WY36 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BBXQ8WY36 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BBXQ8WY36 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
BBXQ8WY36 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
BBXQ8WY36 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
BBXQ8WY36 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
BBXQ8WY36 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
BBXQ8WY36 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
BBXQ8WY36 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BBXQ8WY36 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BBXQ8WY36 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BBXQ8WY36 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
BBXQ8WY36 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
BBXQ8WY36 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
BBXQ8WY36 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
BBXQ8WY36 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
BBXQ8WY36 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BBXQ8WY36 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BBXQ8WY36 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
BBXQ8WY36 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
BBXQ8WY36 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
BBXQ8WY36 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
BBXQ8WY36 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BBXQ8WY36 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BBXQ8WY36 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BBXQ8WY36 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
BBXQ8WY36 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BBXQ8WY36 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BBXQ8WY36 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BBXQ8WY36 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BBXQ8WY36 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BBXQ8WY36 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BBXQ8WY36 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BBXQ8WY36 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BBXQ8WY36 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms