Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVM8

SCFD1, Sec1 family domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCFD1Q8WVM8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SCFD1Q8WVM8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SCFD1Q8WVM8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SCFD1Q8WVM8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SCFD1Q8WVM8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SCFD1Q8WVM8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SCFD1Q8WVM8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
SCFD1Q8WVM8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SCFD1Q8WVM8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SCFD1Q8WVM8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SCFD1Q8WVM8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SCFD1Q8WVM8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCFD1Q8WVM8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCFD1Q8WVM8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SCFD1Q8WVM8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCFD1Q8WVM8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCFD1Q8WVM8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCFD1Q8WVM8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCFD1Q8WVM8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCFD1Q8WVM8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCFD1Q8WVM8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCFD1Q8WVM8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCFD1Q8WVM8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCFD1Q8WVM8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCFD1Q8WVM8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCFD1Q8WVM8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCFD1Q8WVM8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCFD1Q8WVM8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SCFD1Q8WVM8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCFD1Q8WVM8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCFD1Q8WVM8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCFD1Q8WVM8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCFD1Q8WVM8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCFD1Q8WVM8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SCFD1Q8WVM8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SCFD1Q8WVM8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCFD1Q8WVM8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCFD1Q8WVM8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCFD1Q8WVM8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCFD1Q8WVM8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCFD1Q8WVM8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCFD1Q8WVM8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCFD1Q8WVM8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCFD1Q8WVM8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCFD1Q8WVM8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCFD1Q8WVM8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCFD1Q8WVM8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCFD1Q8WVM8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCFD1Q8WVM8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCFD1Q8WVM8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCFD1Q8WVM8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCFD1Q8WVM8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCFD1Q8WVM8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCFD1Q8WVM8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SCFD1Q8WVM8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SCFD1Q8WVM8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SCFD1Q8WVM8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SCFD1Q8WVM8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SCFD1Q8WVM8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCFD1Q8WVM8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCFD1Q8WVM8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SCFD1Q8WVM8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SCFD1Q8WVM8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SCFD1Q8WVM8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SCFD1Q8WVM8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SCFD1Q8WVM8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SCFD1Q8WVM8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SCFD1Q8WVM8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SCFD1Q8WVM8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCFD1Q8WVM8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCFD1Q8WVM8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCFD1Q8WVM8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCFD1Q8WVM8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCFD1Q8WVM8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SCFD1Q8WVM8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SCFD1Q8WVM8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SCFD1Q8WVM8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SCFD1Q8WVM8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SCFD1Q8WVM8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SCFD1Q8WVM8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCFD1Q8WVM8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCFD1Q8WVM8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCFD1Q8WVM8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCFD1Q8WVM8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCFD1Q8WVM8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCFD1Q8WVM8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCFD1Q8WVM8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCFD1Q8WVM8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCFD1Q8WVM8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCFD1Q8WVM8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCFD1Q8WVM8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCFD1Q8WVM8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCFD1Q8WVM8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCFD1Q8WVM8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SCFD1Q8WVM8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCFD1Q8WVM8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCFD1Q8WVM8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCFD1Q8WVM8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCFD1Q8WVM8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCFD1Q8WVM8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms