Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFT2D1Q8WV19 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFT2D1Q8WV19 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFT2D1Q8WV19 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFT2D1Q8WV19 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFT2D1Q8WV19 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFT2D1Q8WV19 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFT2D1Q8WV19 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SFT2D1Q8WV19 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SFT2D1Q8WV19 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SFT2D1Q8WV19 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SFT2D1Q8WV19 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SFT2D1Q8WV19 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SFT2D1Q8WV19 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SFT2D1Q8WV19 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SFT2D1Q8WV19 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SFT2D1Q8WV19 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SFT2D1Q8WV19 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SFT2D1Q8WV19 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SFT2D1Q8WV19 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SFT2D1Q8WV19 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SFT2D1Q8WV19 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SFT2D1Q8WV19 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SFT2D1Q8WV19 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SFT2D1Q8WV19 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SFT2D1Q8WV19 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SFT2D1Q8WV19 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SFT2D1Q8WV19 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SFT2D1Q8WV19 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SFT2D1Q8WV19 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SFT2D1Q8WV19 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SFT2D1Q8WV19 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SFT2D1Q8WV19 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SFT2D1Q8WV19 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SFT2D1Q8WV19 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SFT2D1Q8WV19 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFT2D1Q8WV19 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFT2D1Q8WV19 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFT2D1Q8WV19 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFT2D1Q8WV19 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFT2D1Q8WV19 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFT2D1Q8WV19 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFT2D1Q8WV19 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFT2D1Q8WV19 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFT2D1Q8WV19 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFT2D1Q8WV19 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFT2D1Q8WV19 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFT2D1Q8WV19 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFT2D1Q8WV19 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFT2D1Q8WV19 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFT2D1Q8WV19 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFT2D1Q8WV19 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFT2D1Q8WV19 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFT2D1Q8WV19 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFT2D1Q8WV19 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFT2D1Q8WV19 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFT2D1Q8WV19 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFT2D1Q8WV19 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFT2D1Q8WV19 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFT2D1Q8WV19 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFT2D1Q8WV19 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFT2D1Q8WV19 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFT2D1Q8WV19 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFT2D1Q8WV19 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFT2D1Q8WV19 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFT2D1Q8WV19 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFT2D1Q8WV19 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFT2D1Q8WV19 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFT2D1Q8WV19 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFT2D1Q8WV19 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFT2D1Q8WV19 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFT2D1Q8WV19 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFT2D1Q8WV19 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFT2D1Q8WV19 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFT2D1Q8WV19 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFT2D1Q8WV19 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFT2D1Q8WV19 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFT2D1Q8WV19 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SFT2D1Q8WV19 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SFT2D1Q8WV19 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SFT2D1Q8WV19 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SFT2D1Q8WV19 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SFT2D1Q8WV19 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SFT2D1Q8WV19 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SFT2D1Q8WV19 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SFT2D1Q8WV19 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFT2D1Q8WV19 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFT2D1Q8WV19 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFT2D1Q8WV19 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFT2D1Q8WV19 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFT2D1Q8WV19 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFT2D1Q8WV19 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFT2D1Q8WV19 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFT2D1Q8WV19 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFT2D1Q8WV19 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFT2D1Q8WV19 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFT2D1Q8WV19 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFT2D1Q8WV19 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFT2D1Q8WV19 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFT2D1Q8WV19 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms