Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEY3

SPATA4, Spermatogenesis-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA4Q8NEY3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPATA4Q8NEY3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPATA4Q8NEY3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPATA4Q8NEY3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPATA4Q8NEY3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPATA4Q8NEY3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPATA4Q8NEY3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPATA4Q8NEY3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPATA4Q8NEY3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPATA4Q8NEY3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPATA4Q8NEY3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPATA4Q8NEY3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPATA4Q8NEY3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPATA4Q8NEY3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPATA4Q8NEY3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPATA4Q8NEY3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPATA4Q8NEY3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPATA4Q8NEY3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPATA4Q8NEY3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPATA4Q8NEY3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPATA4Q8NEY3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPATA4Q8NEY3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPATA4Q8NEY3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPATA4Q8NEY3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPATA4Q8NEY3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPATA4Q8NEY3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPATA4Q8NEY3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPATA4Q8NEY3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPATA4Q8NEY3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPATA4Q8NEY3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SPATA4Q8NEY3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPATA4Q8NEY3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPATA4Q8NEY3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPATA4Q8NEY3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPATA4Q8NEY3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPATA4Q8NEY3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPATA4Q8NEY3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPATA4Q8NEY3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SPATA4Q8NEY3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPATA4Q8NEY3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPATA4Q8NEY3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPATA4Q8NEY3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPATA4Q8NEY3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPATA4Q8NEY3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPATA4Q8NEY3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPATA4Q8NEY3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPATA4Q8NEY3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPATA4Q8NEY3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPATA4Q8NEY3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPATA4Q8NEY3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPATA4Q8NEY3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPATA4Q8NEY3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPATA4Q8NEY3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SPATA4Q8NEY3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
SPATA4Q8NEY3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SPATA4Q8NEY3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SPATA4Q8NEY3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SPATA4Q8NEY3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPATA4Q8NEY3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPATA4Q8NEY3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPATA4Q8NEY3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPATA4Q8NEY3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPATA4Q8NEY3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPATA4Q8NEY3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPATA4Q8NEY3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPATA4Q8NEY3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPATA4Q8NEY3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPATA4Q8NEY3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPATA4Q8NEY3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPATA4Q8NEY3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPATA4Q8NEY3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPATA4Q8NEY3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPATA4Q8NEY3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPATA4Q8NEY3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPATA4Q8NEY3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPATA4Q8NEY3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPATA4Q8NEY3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPATA4Q8NEY3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPATA4Q8NEY3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPATA4Q8NEY3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SPATA4Q8NEY3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SPATA4Q8NEY3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SPATA4Q8NEY3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SPATA4Q8NEY3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SPATA4Q8NEY3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SPATA4Q8NEY3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SPATA4Q8NEY3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SPATA4Q8NEY3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SPATA4Q8NEY3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SPATA4Q8NEY3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SPATA4Q8NEY3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SPATA4Q8NEY3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SPATA4Q8NEY3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SPATA4Q8NEY3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SPATA4Q8NEY3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPATA4Q8NEY3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPATA4Q8NEY3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPATA4Q8NEY3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPATA4Q8NEY3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPATA4Q8NEY3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 189.1 ms