Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK8

FAM46D, Putative nucleotidyltransferase FAM46D, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46DQ8NEK8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM46DQ8NEK8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM46DQ8NEK8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM46DQ8NEK8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM46DQ8NEK8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM46DQ8NEK8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM46DQ8NEK8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM46DQ8NEK8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM46DQ8NEK8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM46DQ8NEK8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM46DQ8NEK8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM46DQ8NEK8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM46DQ8NEK8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM46DQ8NEK8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM46DQ8NEK8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM46DQ8NEK8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM46DQ8NEK8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM46DQ8NEK8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM46DQ8NEK8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM46DQ8NEK8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM46DQ8NEK8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM46DQ8NEK8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM46DQ8NEK8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM46DQ8NEK8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM46DQ8NEK8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM46DQ8NEK8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM46DQ8NEK8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM46DQ8NEK8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM46DQ8NEK8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM46DQ8NEK8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM46DQ8NEK8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM46DQ8NEK8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM46DQ8NEK8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM46DQ8NEK8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM46DQ8NEK8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM46DQ8NEK8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM46DQ8NEK8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM46DQ8NEK8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM46DQ8NEK8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM46DQ8NEK8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM46DQ8NEK8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM46DQ8NEK8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM46DQ8NEK8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM46DQ8NEK8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM46DQ8NEK8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
FAM46DQ8NEK8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM46DQ8NEK8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM46DQ8NEK8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM46DQ8NEK8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM46DQ8NEK8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM46DQ8NEK8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM46DQ8NEK8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM46DQ8NEK8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM46DQ8NEK8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM46DQ8NEK8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM46DQ8NEK8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM46DQ8NEK8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM46DQ8NEK8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM46DQ8NEK8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM46DQ8NEK8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM46DQ8NEK8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM46DQ8NEK8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM46DQ8NEK8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM46DQ8NEK8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM46DQ8NEK8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM46DQ8NEK8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM46DQ8NEK8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM46DQ8NEK8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM46DQ8NEK8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM46DQ8NEK8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM46DQ8NEK8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM46DQ8NEK8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM46DQ8NEK8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM46DQ8NEK8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM46DQ8NEK8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM46DQ8NEK8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM46DQ8NEK8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM46DQ8NEK8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM46DQ8NEK8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM46DQ8NEK8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM46DQ8NEK8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM46DQ8NEK8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM46DQ8NEK8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM46DQ8NEK8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM46DQ8NEK8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM46DQ8NEK8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM46DQ8NEK8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM46DQ8NEK8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM46DQ8NEK8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM46DQ8NEK8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM46DQ8NEK8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM46DQ8NEK8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM46DQ8NEK8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM46DQ8NEK8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM46DQ8NEK8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM46DQ8NEK8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM46DQ8NEK8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM46DQ8NEK8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM46DQ8NEK8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM46DQ8NEK8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms