Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC63Q8NA47 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC63Q8NA47 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC63Q8NA47 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC63Q8NA47 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC63Q8NA47 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC63Q8NA47 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC63Q8NA47 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC63Q8NA47 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC63Q8NA47 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC63Q8NA47 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC63Q8NA47 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC63Q8NA47 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC63Q8NA47 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC63Q8NA47 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC63Q8NA47 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC63Q8NA47 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC63Q8NA47 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC63Q8NA47 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC63Q8NA47 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC63Q8NA47 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC63Q8NA47 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC63Q8NA47 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC63Q8NA47 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC63Q8NA47 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC63Q8NA47 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC63Q8NA47 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC63Q8NA47 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC63Q8NA47 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC63Q8NA47 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC63Q8NA47 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC63Q8NA47 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC63Q8NA47 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC63Q8NA47 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC63Q8NA47 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC63Q8NA47 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC63Q8NA47 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC63Q8NA47 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC63Q8NA47 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC63Q8NA47 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC63Q8NA47 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC63Q8NA47 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC63Q8NA47 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC63Q8NA47 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC63Q8NA47 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC63Q8NA47 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC63Q8NA47 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC63Q8NA47 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC63Q8NA47 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC63Q8NA47 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC63Q8NA47 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC63Q8NA47 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC63Q8NA47 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC63Q8NA47 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC63Q8NA47 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC63Q8NA47 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC63Q8NA47 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC63Q8NA47 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC63Q8NA47 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC63Q8NA47 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC63Q8NA47 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC63Q8NA47 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC63Q8NA47 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCDC63Q8NA47 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCDC63Q8NA47 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC63Q8NA47 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC63Q8NA47 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC63Q8NA47 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC63Q8NA47 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC63Q8NA47 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC63Q8NA47 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC63Q8NA47 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC63Q8NA47 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC63Q8NA47 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC63Q8NA47 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC63Q8NA47 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC63Q8NA47 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC63Q8NA47 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC63Q8NA47 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC63Q8NA47 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC63Q8NA47 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC63Q8NA47 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC63Q8NA47 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC63Q8NA47 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC63Q8NA47 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC63Q8NA47 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC63Q8NA47 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC63Q8NA47 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC63Q8NA47 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC63Q8NA47 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC63Q8NA47 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC63Q8NA47 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC63Q8NA47 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC63Q8NA47 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC63Q8NA47 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC63Q8NA47 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC63Q8NA47 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC63Q8NA47 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC63Q8NA47 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC63Q8NA47 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms