Protein–RNA interactions for Protein: Q8N370

SLC43A2, Large neutral amino acids transporter small subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC43A2Q8N370 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC43A2Q8N370 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC43A2Q8N370 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC43A2Q8N370 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC43A2Q8N370 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC43A2Q8N370 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC43A2Q8N370 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC43A2Q8N370 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC43A2Q8N370 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC43A2Q8N370 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC43A2Q8N370 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC43A2Q8N370 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC43A2Q8N370 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC43A2Q8N370 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC43A2Q8N370 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC43A2Q8N370 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC43A2Q8N370 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC43A2Q8N370 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC43A2Q8N370 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC43A2Q8N370 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC43A2Q8N370 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC43A2Q8N370 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC43A2Q8N370 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC43A2Q8N370 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC43A2Q8N370 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC43A2Q8N370 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC43A2Q8N370 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC43A2Q8N370 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC43A2Q8N370 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC43A2Q8N370 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC43A2Q8N370 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC43A2Q8N370 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC43A2Q8N370 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC43A2Q8N370 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC43A2Q8N370 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC43A2Q8N370 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC43A2Q8N370 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC43A2Q8N370 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
SLC43A2Q8N370 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC43A2Q8N370 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC43A2Q8N370 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC43A2Q8N370 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC43A2Q8N370 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC43A2Q8N370 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC43A2Q8N370 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC43A2Q8N370 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC43A2Q8N370 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC43A2Q8N370 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC43A2Q8N370 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC43A2Q8N370 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC43A2Q8N370 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC43A2Q8N370 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC43A2Q8N370 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC43A2Q8N370 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC43A2Q8N370 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC43A2Q8N370 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC43A2Q8N370 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC43A2Q8N370 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC43A2Q8N370 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC43A2Q8N370 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC43A2Q8N370 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC43A2Q8N370 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC43A2Q8N370 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC43A2Q8N370 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC43A2Q8N370 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC43A2Q8N370 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC43A2Q8N370 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC43A2Q8N370 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC43A2Q8N370 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC43A2Q8N370 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC43A2Q8N370 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC43A2Q8N370 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC43A2Q8N370 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC43A2Q8N370 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC43A2Q8N370 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC43A2Q8N370 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC43A2Q8N370 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC43A2Q8N370 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC43A2Q8N370 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC43A2Q8N370 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC43A2Q8N370 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC43A2Q8N370 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC43A2Q8N370 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC43A2Q8N370 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC43A2Q8N370 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC43A2Q8N370 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC43A2Q8N370 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC43A2Q8N370 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC43A2Q8N370 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC43A2Q8N370 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC43A2Q8N370 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC43A2Q8N370 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC43A2Q8N370 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC43A2Q8N370 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC43A2Q8N370 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC43A2Q8N370 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC43A2Q8N370 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC43A2Q8N370 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC43A2Q8N370 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC43A2Q8N370 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms