Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1W1

ARHGEF28, Rho guanine nucleotide exchange factor 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF28Q8N1W1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
ARHGEF28Q8N1W1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
ARHGEF28Q8N1W1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
ARHGEF28Q8N1W1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
ARHGEF28Q8N1W1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
ARHGEF28Q8N1W1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
ARHGEF28Q8N1W1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
ARHGEF28Q8N1W1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
ARHGEF28Q8N1W1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
ARHGEF28Q8N1W1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
ARHGEF28Q8N1W1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
ARHGEF28Q8N1W1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC36.24■■■■□ 3.39
ARHGEF28Q8N1W1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
ARHGEF28Q8N1W1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
ARHGEF28Q8N1W1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
ARHGEF28Q8N1W1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
ARHGEF28Q8N1W1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
ARHGEF28Q8N1W1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
ARHGEF28Q8N1W1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
ARHGEF28Q8N1W1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
ARHGEF28Q8N1W1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
ARHGEF28Q8N1W1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
ARHGEF28Q8N1W1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
ARHGEF28Q8N1W1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
ARHGEF28Q8N1W1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
ARHGEF28Q8N1W1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
ARHGEF28Q8N1W1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
ARHGEF28Q8N1W1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
ARHGEF28Q8N1W1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
ARHGEF28Q8N1W1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
ARHGEF28Q8N1W1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
ARHGEF28Q8N1W1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
ARHGEF28Q8N1W1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
ARHGEF28Q8N1W1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
ARHGEF28Q8N1W1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
ARHGEF28Q8N1W1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
ARHGEF28Q8N1W1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
ARHGEF28Q8N1W1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
ARHGEF28Q8N1W1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC36.16■■■■□ 3.38
ARHGEF28Q8N1W1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
ARHGEF28Q8N1W1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
ARHGEF28Q8N1W1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
ARHGEF28Q8N1W1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
ARHGEF28Q8N1W1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC36.14■■■■□ 3.38
ARHGEF28Q8N1W1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
ARHGEF28Q8N1W1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
ARHGEF28Q8N1W1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
ARHGEF28Q8N1W1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
ARHGEF28Q8N1W1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
ARHGEF28Q8N1W1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
ARHGEF28Q8N1W1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
ARHGEF28Q8N1W1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
ARHGEF28Q8N1W1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
ARHGEF28Q8N1W1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
ARHGEF28Q8N1W1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
ARHGEF28Q8N1W1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
ARHGEF28Q8N1W1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
ARHGEF28Q8N1W1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
ARHGEF28Q8N1W1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
ARHGEF28Q8N1W1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
ARHGEF28Q8N1W1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
ARHGEF28Q8N1W1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
ARHGEF28Q8N1W1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
ARHGEF28Q8N1W1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC36.07■■■■□ 3.37
ARHGEF28Q8N1W1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
ARHGEF28Q8N1W1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
ARHGEF28Q8N1W1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
ARHGEF28Q8N1W1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
ARHGEF28Q8N1W1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
ARHGEF28Q8N1W1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
ARHGEF28Q8N1W1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
ARHGEF28Q8N1W1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
ARHGEF28Q8N1W1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
ARHGEF28Q8N1W1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
ARHGEF28Q8N1W1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
ARHGEF28Q8N1W1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
ARHGEF28Q8N1W1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
ARHGEF28Q8N1W1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
ARHGEF28Q8N1W1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
ARHGEF28Q8N1W1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
ARHGEF28Q8N1W1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
ARHGEF28Q8N1W1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC36.03■■■■□ 3.36
ARHGEF28Q8N1W1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
ARHGEF28Q8N1W1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
ARHGEF28Q8N1W1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
ARHGEF28Q8N1W1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.35
ARHGEF28Q8N1W1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
ARHGEF28Q8N1W1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
ARHGEF28Q8N1W1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
ARHGEF28Q8N1W1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
ARHGEF28Q8N1W1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
ARHGEF28Q8N1W1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
ARHGEF28Q8N1W1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
ARHGEF28Q8N1W1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
ARHGEF28Q8N1W1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
ARHGEF28Q8N1W1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
ARHGEF28Q8N1W1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
ARHGEF28Q8N1W1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
ARHGEF28Q8N1W1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
ARHGEF28Q8N1W1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
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