Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWZ8

SUGP1, SURP and G-patch domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUGP1Q8IWZ8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SUGP1Q8IWZ8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SUGP1Q8IWZ8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SUGP1Q8IWZ8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SUGP1Q8IWZ8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SUGP1Q8IWZ8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SUGP1Q8IWZ8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SUGP1Q8IWZ8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SUGP1Q8IWZ8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SUGP1Q8IWZ8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SUGP1Q8IWZ8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SUGP1Q8IWZ8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SUGP1Q8IWZ8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SUGP1Q8IWZ8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SUGP1Q8IWZ8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SUGP1Q8IWZ8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SUGP1Q8IWZ8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SUGP1Q8IWZ8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SUGP1Q8IWZ8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SUGP1Q8IWZ8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SUGP1Q8IWZ8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SUGP1Q8IWZ8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SUGP1Q8IWZ8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SUGP1Q8IWZ8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SUGP1Q8IWZ8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SUGP1Q8IWZ8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SUGP1Q8IWZ8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SUGP1Q8IWZ8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SUGP1Q8IWZ8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SUGP1Q8IWZ8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SUGP1Q8IWZ8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SUGP1Q8IWZ8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SUGP1Q8IWZ8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SUGP1Q8IWZ8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SUGP1Q8IWZ8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SUGP1Q8IWZ8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SUGP1Q8IWZ8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SUGP1Q8IWZ8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SUGP1Q8IWZ8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SUGP1Q8IWZ8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SUGP1Q8IWZ8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SUGP1Q8IWZ8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SUGP1Q8IWZ8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SUGP1Q8IWZ8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SUGP1Q8IWZ8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SUGP1Q8IWZ8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SUGP1Q8IWZ8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SUGP1Q8IWZ8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SUGP1Q8IWZ8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SUGP1Q8IWZ8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SUGP1Q8IWZ8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SUGP1Q8IWZ8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SUGP1Q8IWZ8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SUGP1Q8IWZ8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SUGP1Q8IWZ8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SUGP1Q8IWZ8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SUGP1Q8IWZ8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SUGP1Q8IWZ8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SUGP1Q8IWZ8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SUGP1Q8IWZ8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SUGP1Q8IWZ8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SUGP1Q8IWZ8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SUGP1Q8IWZ8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SUGP1Q8IWZ8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SUGP1Q8IWZ8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SUGP1Q8IWZ8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SUGP1Q8IWZ8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SUGP1Q8IWZ8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SUGP1Q8IWZ8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SUGP1Q8IWZ8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SUGP1Q8IWZ8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SUGP1Q8IWZ8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SUGP1Q8IWZ8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SUGP1Q8IWZ8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SUGP1Q8IWZ8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SUGP1Q8IWZ8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SUGP1Q8IWZ8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SUGP1Q8IWZ8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SUGP1Q8IWZ8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SUGP1Q8IWZ8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SUGP1Q8IWZ8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SUGP1Q8IWZ8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SUGP1Q8IWZ8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SUGP1Q8IWZ8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SUGP1Q8IWZ8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SUGP1Q8IWZ8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
SUGP1Q8IWZ8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SUGP1Q8IWZ8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SUGP1Q8IWZ8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SUGP1Q8IWZ8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SUGP1Q8IWZ8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SUGP1Q8IWZ8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SUGP1Q8IWZ8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SUGP1Q8IWZ8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SUGP1Q8IWZ8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SUGP1Q8IWZ8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SUGP1Q8IWZ8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SUGP1Q8IWZ8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SUGP1Q8IWZ8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SUGP1Q8IWZ8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms