Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PPFIBP1Q86W92 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PPFIBP1Q86W92 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PPFIBP1Q86W92 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PPFIBP1Q86W92 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PPFIBP1Q86W92 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PPFIBP1Q86W92 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PPFIBP1Q86W92 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PPFIBP1Q86W92 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PPFIBP1Q86W92 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPFIBP1Q86W92 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PPFIBP1Q86W92 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PPFIBP1Q86W92 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PPFIBP1Q86W92 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PPFIBP1Q86W92 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPFIBP1Q86W92 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPFIBP1Q86W92 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPFIBP1Q86W92 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPFIBP1Q86W92 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPFIBP1Q86W92 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPFIBP1Q86W92 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPFIBP1Q86W92 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPFIBP1Q86W92 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PPFIBP1Q86W92 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PPFIBP1Q86W92 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PPFIBP1Q86W92 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PPFIBP1Q86W92 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PPFIBP1Q86W92 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPFIBP1Q86W92 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPFIBP1Q86W92 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPFIBP1Q86W92 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPFIBP1Q86W92 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
PPFIBP1Q86W92 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PPFIBP1Q86W92 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PPFIBP1Q86W92 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PPFIBP1Q86W92 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PPFIBP1Q86W92 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PPFIBP1Q86W92 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PPFIBP1Q86W92 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PPFIBP1Q86W92 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
PPFIBP1Q86W92 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
PPFIBP1Q86W92 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PPFIBP1Q86W92 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PPFIBP1Q86W92 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PPFIBP1Q86W92 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PPFIBP1Q86W92 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PPFIBP1Q86W92 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PPFIBP1Q86W92 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PPFIBP1Q86W92 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PPFIBP1Q86W92 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PPFIBP1Q86W92 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PPFIBP1Q86W92 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PPFIBP1Q86W92 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PPFIBP1Q86W92 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PPFIBP1Q86W92 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PPFIBP1Q86W92 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PPFIBP1Q86W92 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PPFIBP1Q86W92 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PPFIBP1Q86W92 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PPFIBP1Q86W92 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PPFIBP1Q86W92 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PPFIBP1Q86W92 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PPFIBP1Q86W92 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PPFIBP1Q86W92 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPFIBP1Q86W92 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPFIBP1Q86W92 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPFIBP1Q86W92 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPFIBP1Q86W92 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PPFIBP1Q86W92 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
PPFIBP1Q86W92 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
PPFIBP1Q86W92 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PPFIBP1Q86W92 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PPFIBP1Q86W92 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PPFIBP1Q86W92 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PPFIBP1Q86W92 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPFIBP1Q86W92 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PPFIBP1Q86W92 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PPFIBP1Q86W92 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PPFIBP1Q86W92 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PPFIBP1Q86W92 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PPFIBP1Q86W92 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PPFIBP1Q86W92 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PPFIBP1Q86W92 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PPFIBP1Q86W92 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPFIBP1Q86W92 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPFIBP1Q86W92 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PPFIBP1Q86W92 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PPFIBP1Q86W92 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PPFIBP1Q86W92 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PPFIBP1Q86W92 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PPFIBP1Q86W92 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PPFIBP1Q86W92 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.33■■■□□ 2.12
PPFIBP1Q86W92 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PPFIBP1Q86W92 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PPFIBP1Q86W92 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PPFIBP1Q86W92 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PPFIBP1Q86W92 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PPFIBP1Q86W92 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PPFIBP1Q86W92 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PPFIBP1Q86W92 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms