Protein–RNA interactions for Protein: Q86UR5

RIMS1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS1Q86UR5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
RIMS1Q86UR5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC38.74■■■■□ 3.79
RIMS1Q86UR5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
RIMS1Q86UR5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC38.74■■■■□ 3.79
RIMS1Q86UR5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
RIMS1Q86UR5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC38.7■■■■□ 3.79
RIMS1Q86UR5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC38.7■■■■□ 3.79
RIMS1Q86UR5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
RIMS1Q86UR5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
RIMS1Q86UR5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
RIMS1Q86UR5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
RIMS1Q86UR5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
RIMS1Q86UR5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
RIMS1Q86UR5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.68■■■■□ 3.78
RIMS1Q86UR5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC38.68■■■■□ 3.78
RIMS1Q86UR5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
RIMS1Q86UR5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
RIMS1Q86UR5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC38.66■■■■□ 3.78
RIMS1Q86UR5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
RIMS1Q86UR5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
RIMS1Q86UR5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC38.64■■■■□ 3.78
RIMS1Q86UR5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC38.64■■■■□ 3.78
RIMS1Q86UR5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC38.64■■■■□ 3.78
RIMS1Q86UR5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
RIMS1Q86UR5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
RIMS1Q86UR5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
RIMS1Q86UR5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
RIMS1Q86UR5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
RIMS1Q86UR5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
RIMS1Q86UR5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
RIMS1Q86UR5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
RIMS1Q86UR5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
RIMS1Q86UR5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
RIMS1Q86UR5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
RIMS1Q86UR5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
RIMS1Q86UR5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC38.55■■■■□ 3.76
RIMS1Q86UR5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
RIMS1Q86UR5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
RIMS1Q86UR5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
RIMS1Q86UR5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
RIMS1Q86UR5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
RIMS1Q86UR5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
RIMS1Q86UR5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC38.5■■■■□ 3.75
RIMS1Q86UR5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
RIMS1Q86UR5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC38.49■■■■□ 3.75
RIMS1Q86UR5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
RIMS1Q86UR5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.48■■■■□ 3.75
RIMS1Q86UR5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
RIMS1Q86UR5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
RIMS1Q86UR5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
RIMS1Q86UR5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
RIMS1Q86UR5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC38.46■■■■□ 3.75
RIMS1Q86UR5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
RIMS1Q86UR5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
RIMS1Q86UR5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC38.46■■■■□ 3.75
RIMS1Q86UR5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
RIMS1Q86UR5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
RIMS1Q86UR5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
RIMS1Q86UR5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC38.44■■■■□ 3.74
RIMS1Q86UR5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
RIMS1Q86UR5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.74
RIMS1Q86UR5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
RIMS1Q86UR5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
RIMS1Q86UR5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
RIMS1Q86UR5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
RIMS1Q86UR5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
RIMS1Q86UR5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
RIMS1Q86UR5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
RIMS1Q86UR5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
RIMS1Q86UR5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC38.39■■■■□ 3.74
RIMS1Q86UR5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
RIMS1Q86UR5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
RIMS1Q86UR5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
RIMS1Q86UR5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC38.38■■■■□ 3.73
RIMS1Q86UR5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
RIMS1Q86UR5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
RIMS1Q86UR5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC38.37■■■■□ 3.73
RIMS1Q86UR5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
RIMS1Q86UR5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
RIMS1Q86UR5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
RIMS1Q86UR5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
RIMS1Q86UR5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
RIMS1Q86UR5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
RIMS1Q86UR5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
RIMS1Q86UR5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
RIMS1Q86UR5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
RIMS1Q86UR5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
RIMS1Q86UR5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
RIMS1Q86UR5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
RIMS1Q86UR5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
RIMS1Q86UR5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
RIMS1Q86UR5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
RIMS1Q86UR5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
RIMS1Q86UR5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
RIMS1Q86UR5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
RIMS1Q86UR5 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
RIMS1Q86UR5 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
RIMS1Q86UR5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
RIMS1Q86UR5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
RIMS1Q86UR5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms