Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.78■■■■□ 3.64
STRCQ7RTU9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
STRCQ7RTU9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
STRCQ7RTU9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
STRCQ7RTU9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
STRCQ7RTU9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
STRCQ7RTU9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
STRCQ7RTU9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.76■■■■□ 3.64
STRCQ7RTU9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
STRCQ7RTU9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC37.75■■■■□ 3.63
STRCQ7RTU9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
STRCQ7RTU9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
STRCQ7RTU9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
STRCQ7RTU9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
STRCQ7RTU9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
STRCQ7RTU9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC37.73■■■■□ 3.63
STRCQ7RTU9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
STRCQ7RTU9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
STRCQ7RTU9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
STRCQ7RTU9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
STRCQ7RTU9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
STRCQ7RTU9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
STRCQ7RTU9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC37.68■■■■□ 3.62
STRCQ7RTU9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
STRCQ7RTU9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
STRCQ7RTU9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
STRCQ7RTU9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
STRCQ7RTU9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
STRCQ7RTU9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
STRCQ7RTU9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
STRCQ7RTU9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
STRCQ7RTU9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
STRCQ7RTU9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
STRCQ7RTU9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
STRCQ7RTU9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC37.63■■■■□ 3.61
STRCQ7RTU9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
STRCQ7RTU9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
STRCQ7RTU9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
STRCQ7RTU9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC37.62■■■■□ 3.61
STRCQ7RTU9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
STRCQ7RTU9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
STRCQ7RTU9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
STRCQ7RTU9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
STRCQ7RTU9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
STRCQ7RTU9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
STRCQ7RTU9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
STRCQ7RTU9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
STRCQ7RTU9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.61
STRCQ7RTU9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
STRCQ7RTU9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
STRCQ7RTU9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
STRCQ7RTU9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC37.53■■■■□ 3.6
STRCQ7RTU9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
STRCQ7RTU9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
STRCQ7RTU9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
STRCQ7RTU9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
STRCQ7RTU9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
STRCQ7RTU9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
STRCQ7RTU9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
STRCQ7RTU9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
STRCQ7RTU9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
STRCQ7RTU9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
STRCQ7RTU9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
STRCQ7RTU9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
STRCQ7RTU9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
STRCQ7RTU9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
STRCQ7RTU9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
STRCQ7RTU9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
STRCQ7RTU9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
STRCQ7RTU9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
STRCQ7RTU9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.58
STRCQ7RTU9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
STRCQ7RTU9 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
STRCQ7RTU9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
STRCQ7RTU9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
STRCQ7RTU9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
STRCQ7RTU9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
STRCQ7RTU9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
STRCQ7RTU9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
STRCQ7RTU9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
STRCQ7RTU9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
STRCQ7RTU9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
STRCQ7RTU9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.39■■■■□ 3.58
STRCQ7RTU9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
STRCQ7RTU9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
STRCQ7RTU9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
STRCQ7RTU9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
STRCQ7RTU9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
STRCQ7RTU9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC37.34■■■■□ 3.57
STRCQ7RTU9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
STRCQ7RTU9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
STRCQ7RTU9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
STRCQ7RTU9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
STRCQ7RTU9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
STRCQ7RTU9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.56
STRCQ7RTU9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
STRCQ7RTU9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
STRCQ7RTU9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
STRCQ7RTU9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
STRCQ7RTU9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms