Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAPN12Q6ZSI9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAPN12Q6ZSI9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAPN12Q6ZSI9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAPN12Q6ZSI9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CAPN12Q6ZSI9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAPN12Q6ZSI9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAPN12Q6ZSI9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAPN12Q6ZSI9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAPN12Q6ZSI9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CAPN12Q6ZSI9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAPN12Q6ZSI9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAPN12Q6ZSI9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAPN12Q6ZSI9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAPN12Q6ZSI9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAPN12Q6ZSI9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAPN12Q6ZSI9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAPN12Q6ZSI9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CAPN12Q6ZSI9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAPN12Q6ZSI9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAPN12Q6ZSI9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAPN12Q6ZSI9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAPN12Q6ZSI9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CAPN12Q6ZSI9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CAPN12Q6ZSI9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAPN12Q6ZSI9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CAPN12Q6ZSI9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAPN12Q6ZSI9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAPN12Q6ZSI9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAPN12Q6ZSI9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAPN12Q6ZSI9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CAPN12Q6ZSI9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CAPN12Q6ZSI9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CAPN12Q6ZSI9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAPN12Q6ZSI9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAPN12Q6ZSI9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CAPN12Q6ZSI9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAPN12Q6ZSI9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAPN12Q6ZSI9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAPN12Q6ZSI9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CAPN12Q6ZSI9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAPN12Q6ZSI9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAPN12Q6ZSI9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPN12Q6ZSI9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPN12Q6ZSI9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPN12Q6ZSI9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPN12Q6ZSI9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPN12Q6ZSI9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPN12Q6ZSI9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CAPN12Q6ZSI9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CAPN12Q6ZSI9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CAPN12Q6ZSI9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CAPN12Q6ZSI9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CAPN12Q6ZSI9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CAPN12Q6ZSI9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAPN12Q6ZSI9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAPN12Q6ZSI9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAPN12Q6ZSI9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAPN12Q6ZSI9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CAPN12Q6ZSI9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAPN12Q6ZSI9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAPN12Q6ZSI9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAPN12Q6ZSI9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAPN12Q6ZSI9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAPN12Q6ZSI9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAPN12Q6ZSI9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CAPN12Q6ZSI9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CAPN12Q6ZSI9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CAPN12Q6ZSI9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAPN12Q6ZSI9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAPN12Q6ZSI9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAPN12Q6ZSI9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAPN12Q6ZSI9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAPN12Q6ZSI9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAPN12Q6ZSI9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAPN12Q6ZSI9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAPN12Q6ZSI9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAPN12Q6ZSI9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAPN12Q6ZSI9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAPN12Q6ZSI9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAPN12Q6ZSI9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAPN12Q6ZSI9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAPN12Q6ZSI9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAPN12Q6ZSI9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAPN12Q6ZSI9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAPN12Q6ZSI9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAPN12Q6ZSI9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAPN12Q6ZSI9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAPN12Q6ZSI9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAPN12Q6ZSI9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAPN12Q6ZSI9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAPN12Q6ZSI9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAPN12Q6ZSI9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAPN12Q6ZSI9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CAPN12Q6ZSI9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CAPN12Q6ZSI9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAPN12Q6ZSI9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAPN12Q6ZSI9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAPN12Q6ZSI9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAPN12Q6ZSI9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159.4 ms