Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY18

LINGO4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO4Q6UY18 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
LINGO4Q6UY18 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
LINGO4Q6UY18 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
LINGO4Q6UY18 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
LINGO4Q6UY18 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
LINGO4Q6UY18 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
LINGO4Q6UY18 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
LINGO4Q6UY18 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LINGO4Q6UY18 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LINGO4Q6UY18 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LINGO4Q6UY18 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LINGO4Q6UY18 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LINGO4Q6UY18 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LINGO4Q6UY18 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
LINGO4Q6UY18 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LINGO4Q6UY18 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LINGO4Q6UY18 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LINGO4Q6UY18 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LINGO4Q6UY18 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LINGO4Q6UY18 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LINGO4Q6UY18 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LINGO4Q6UY18 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LINGO4Q6UY18 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LINGO4Q6UY18 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LINGO4Q6UY18 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LINGO4Q6UY18 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LINGO4Q6UY18 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LINGO4Q6UY18 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LINGO4Q6UY18 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LINGO4Q6UY18 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LINGO4Q6UY18 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LINGO4Q6UY18 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LINGO4Q6UY18 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LINGO4Q6UY18 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LINGO4Q6UY18 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LINGO4Q6UY18 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LINGO4Q6UY18 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
LINGO4Q6UY18 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LINGO4Q6UY18 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
LINGO4Q6UY18 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LINGO4Q6UY18 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LINGO4Q6UY18 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LINGO4Q6UY18 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LINGO4Q6UY18 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
LINGO4Q6UY18 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
LINGO4Q6UY18 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LINGO4Q6UY18 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LINGO4Q6UY18 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LINGO4Q6UY18 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LINGO4Q6UY18 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LINGO4Q6UY18 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LINGO4Q6UY18 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LINGO4Q6UY18 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
LINGO4Q6UY18 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LINGO4Q6UY18 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LINGO4Q6UY18 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LINGO4Q6UY18 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
LINGO4Q6UY18 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LINGO4Q6UY18 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LINGO4Q6UY18 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LINGO4Q6UY18 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LINGO4Q6UY18 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LINGO4Q6UY18 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
LINGO4Q6UY18 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LINGO4Q6UY18 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LINGO4Q6UY18 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LINGO4Q6UY18 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LINGO4Q6UY18 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LINGO4Q6UY18 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LINGO4Q6UY18 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LINGO4Q6UY18 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LINGO4Q6UY18 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LINGO4Q6UY18 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LINGO4Q6UY18 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
LINGO4Q6UY18 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LINGO4Q6UY18 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LINGO4Q6UY18 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LINGO4Q6UY18 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LINGO4Q6UY18 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LINGO4Q6UY18 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LINGO4Q6UY18 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LINGO4Q6UY18 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LINGO4Q6UY18 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LINGO4Q6UY18 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
LINGO4Q6UY18 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LINGO4Q6UY18 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LINGO4Q6UY18 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LINGO4Q6UY18 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LINGO4Q6UY18 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LINGO4Q6UY18 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LINGO4Q6UY18 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LINGO4Q6UY18 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LINGO4Q6UY18 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LINGO4Q6UY18 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LINGO4Q6UY18 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LINGO4Q6UY18 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LINGO4Q6UY18 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LINGO4Q6UY18 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LINGO4Q6UY18 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LINGO4Q6UY18 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms