Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWF3

SCIMP, SLP adapter and CSK-interacting membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCIMPQ6UWF3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCIMPQ6UWF3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCIMPQ6UWF3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCIMPQ6UWF3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCIMPQ6UWF3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCIMPQ6UWF3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SCIMPQ6UWF3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCIMPQ6UWF3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCIMPQ6UWF3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCIMPQ6UWF3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCIMPQ6UWF3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCIMPQ6UWF3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCIMPQ6UWF3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCIMPQ6UWF3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCIMPQ6UWF3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCIMPQ6UWF3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCIMPQ6UWF3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SCIMPQ6UWF3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCIMPQ6UWF3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCIMPQ6UWF3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCIMPQ6UWF3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCIMPQ6UWF3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCIMPQ6UWF3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCIMPQ6UWF3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCIMPQ6UWF3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCIMPQ6UWF3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCIMPQ6UWF3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SCIMPQ6UWF3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCIMPQ6UWF3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCIMPQ6UWF3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCIMPQ6UWF3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCIMPQ6UWF3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCIMPQ6UWF3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCIMPQ6UWF3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCIMPQ6UWF3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCIMPQ6UWF3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCIMPQ6UWF3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SCIMPQ6UWF3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCIMPQ6UWF3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCIMPQ6UWF3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCIMPQ6UWF3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCIMPQ6UWF3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCIMPQ6UWF3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCIMPQ6UWF3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCIMPQ6UWF3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCIMPQ6UWF3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCIMPQ6UWF3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCIMPQ6UWF3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCIMPQ6UWF3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
SCIMPQ6UWF3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SCIMPQ6UWF3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCIMPQ6UWF3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCIMPQ6UWF3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCIMPQ6UWF3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCIMPQ6UWF3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCIMPQ6UWF3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCIMPQ6UWF3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCIMPQ6UWF3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCIMPQ6UWF3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCIMPQ6UWF3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCIMPQ6UWF3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCIMPQ6UWF3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCIMPQ6UWF3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCIMPQ6UWF3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCIMPQ6UWF3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCIMPQ6UWF3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCIMPQ6UWF3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCIMPQ6UWF3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCIMPQ6UWF3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCIMPQ6UWF3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCIMPQ6UWF3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCIMPQ6UWF3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCIMPQ6UWF3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCIMPQ6UWF3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCIMPQ6UWF3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SCIMPQ6UWF3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SCIMPQ6UWF3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCIMPQ6UWF3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCIMPQ6UWF3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SCIMPQ6UWF3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SCIMPQ6UWF3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SCIMPQ6UWF3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCIMPQ6UWF3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCIMPQ6UWF3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCIMPQ6UWF3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCIMPQ6UWF3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SCIMPQ6UWF3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCIMPQ6UWF3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCIMPQ6UWF3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCIMPQ6UWF3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCIMPQ6UWF3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCIMPQ6UWF3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCIMPQ6UWF3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCIMPQ6UWF3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCIMPQ6UWF3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCIMPQ6UWF3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCIMPQ6UWF3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCIMPQ6UWF3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCIMPQ6UWF3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCIMPQ6UWF3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms