Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW78

UQCC3, Ubiquinol-cytochrome-c reductase complex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UQCC3Q6UW78 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
UQCC3Q6UW78 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
UQCC3Q6UW78 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
UQCC3Q6UW78 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
UQCC3Q6UW78 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
UQCC3Q6UW78 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
UQCC3Q6UW78 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
UQCC3Q6UW78 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
UQCC3Q6UW78 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
UQCC3Q6UW78 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
UQCC3Q6UW78 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
UQCC3Q6UW78 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
UQCC3Q6UW78 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
UQCC3Q6UW78 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
UQCC3Q6UW78 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
UQCC3Q6UW78 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
UQCC3Q6UW78 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
UQCC3Q6UW78 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
UQCC3Q6UW78 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
UQCC3Q6UW78 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
UQCC3Q6UW78 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
UQCC3Q6UW78 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
UQCC3Q6UW78 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
UQCC3Q6UW78 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
UQCC3Q6UW78 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
UQCC3Q6UW78 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
UQCC3Q6UW78 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
UQCC3Q6UW78 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
UQCC3Q6UW78 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
UQCC3Q6UW78 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UQCC3Q6UW78 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UQCC3Q6UW78 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UQCC3Q6UW78 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
UQCC3Q6UW78 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UQCC3Q6UW78 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UQCC3Q6UW78 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UQCC3Q6UW78 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UQCC3Q6UW78 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UQCC3Q6UW78 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UQCC3Q6UW78 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UQCC3Q6UW78 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UQCC3Q6UW78 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
UQCC3Q6UW78 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UQCC3Q6UW78 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UQCC3Q6UW78 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UQCC3Q6UW78 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
UQCC3Q6UW78 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
UQCC3Q6UW78 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UQCC3Q6UW78 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UQCC3Q6UW78 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UQCC3Q6UW78 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UQCC3Q6UW78 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UQCC3Q6UW78 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UQCC3Q6UW78 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UQCC3Q6UW78 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UQCC3Q6UW78 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UQCC3Q6UW78 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UQCC3Q6UW78 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UQCC3Q6UW78 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UQCC3Q6UW78 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UQCC3Q6UW78 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UQCC3Q6UW78 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UQCC3Q6UW78 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UQCC3Q6UW78 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UQCC3Q6UW78 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UQCC3Q6UW78 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UQCC3Q6UW78 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UQCC3Q6UW78 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UQCC3Q6UW78 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UQCC3Q6UW78 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UQCC3Q6UW78 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UQCC3Q6UW78 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UQCC3Q6UW78 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
UQCC3Q6UW78 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
UQCC3Q6UW78 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
UQCC3Q6UW78 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UQCC3Q6UW78 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UQCC3Q6UW78 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UQCC3Q6UW78 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UQCC3Q6UW78 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UQCC3Q6UW78 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UQCC3Q6UW78 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UQCC3Q6UW78 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UQCC3Q6UW78 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
UQCC3Q6UW78 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UQCC3Q6UW78 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UQCC3Q6UW78 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UQCC3Q6UW78 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UQCC3Q6UW78 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UQCC3Q6UW78 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UQCC3Q6UW78 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UQCC3Q6UW78 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UQCC3Q6UW78 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UQCC3Q6UW78 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UQCC3Q6UW78 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UQCC3Q6UW78 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UQCC3Q6UW78 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UQCC3Q6UW78 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UQCC3Q6UW78 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UQCC3Q6UW78 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms