Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
TNS3Q68CZ2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
TNS3Q68CZ2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
TNS3Q68CZ2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
TNS3Q68CZ2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
TNS3Q68CZ2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
TNS3Q68CZ2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
TNS3Q68CZ2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
TNS3Q68CZ2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
TNS3Q68CZ2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
TNS3Q68CZ2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
TNS3Q68CZ2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
TNS3Q68CZ2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
TNS3Q68CZ2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
TNS3Q68CZ2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
TNS3Q68CZ2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
TNS3Q68CZ2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
TNS3Q68CZ2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
TNS3Q68CZ2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
TNS3Q68CZ2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
TNS3Q68CZ2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
TNS3Q68CZ2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
TNS3Q68CZ2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
TNS3Q68CZ2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
TNS3Q68CZ2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
TNS3Q68CZ2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
TNS3Q68CZ2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC35.4■■■■□ 3.26
TNS3Q68CZ2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
TNS3Q68CZ2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
TNS3Q68CZ2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
TNS3Q68CZ2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
TNS3Q68CZ2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
TNS3Q68CZ2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
TNS3Q68CZ2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
TNS3Q68CZ2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
TNS3Q68CZ2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
TNS3Q68CZ2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
TNS3Q68CZ2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
TNS3Q68CZ2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
TNS3Q68CZ2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
TNS3Q68CZ2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
TNS3Q68CZ2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.25
TNS3Q68CZ2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC35.32■■■■□ 3.25
TNS3Q68CZ2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
TNS3Q68CZ2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
TNS3Q68CZ2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
TNS3Q68CZ2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.31■■■■□ 3.24
TNS3Q68CZ2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
TNS3Q68CZ2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
TNS3Q68CZ2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
TNS3Q68CZ2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
TNS3Q68CZ2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
TNS3Q68CZ2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
TNS3Q68CZ2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
TNS3Q68CZ2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
TNS3Q68CZ2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
TNS3Q68CZ2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.23
TNS3Q68CZ2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
TNS3Q68CZ2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
TNS3Q68CZ2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
TNS3Q68CZ2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
TNS3Q68CZ2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
TNS3Q68CZ2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
TNS3Q68CZ2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
TNS3Q68CZ2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
TNS3Q68CZ2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
TNS3Q68CZ2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
TNS3Q68CZ2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
TNS3Q68CZ2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
TNS3Q68CZ2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
TNS3Q68CZ2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
TNS3Q68CZ2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
TNS3Q68CZ2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
TNS3Q68CZ2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
TNS3Q68CZ2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
TNS3Q68CZ2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
TNS3Q68CZ2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
TNS3Q68CZ2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
TNS3Q68CZ2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
TNS3Q68CZ2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
TNS3Q68CZ2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
TNS3Q68CZ2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
TNS3Q68CZ2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
TNS3Q68CZ2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
TNS3Q68CZ2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
TNS3Q68CZ2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
TNS3Q68CZ2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
TNS3Q68CZ2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
TNS3Q68CZ2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
TNS3Q68CZ2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
TNS3Q68CZ2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
TNS3Q68CZ2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
TNS3Q68CZ2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC35.12■■■■□ 3.21
TNS3Q68CZ2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
TNS3Q68CZ2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
TNS3Q68CZ2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
TNS3Q68CZ2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
TNS3Q68CZ2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
TNS3Q68CZ2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
TNS3Q68CZ2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169.6 ms