Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PXDC1Q5TGL8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PXDC1Q5TGL8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PXDC1Q5TGL8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PXDC1Q5TGL8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PXDC1Q5TGL8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PXDC1Q5TGL8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PXDC1Q5TGL8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PXDC1Q5TGL8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PXDC1Q5TGL8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PXDC1Q5TGL8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PXDC1Q5TGL8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PXDC1Q5TGL8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PXDC1Q5TGL8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PXDC1Q5TGL8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PXDC1Q5TGL8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PXDC1Q5TGL8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PXDC1Q5TGL8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PXDC1Q5TGL8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PXDC1Q5TGL8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PXDC1Q5TGL8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PXDC1Q5TGL8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PXDC1Q5TGL8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PXDC1Q5TGL8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PXDC1Q5TGL8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PXDC1Q5TGL8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PXDC1Q5TGL8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PXDC1Q5TGL8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PXDC1Q5TGL8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PXDC1Q5TGL8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PXDC1Q5TGL8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PXDC1Q5TGL8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PXDC1Q5TGL8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PXDC1Q5TGL8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PXDC1Q5TGL8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PXDC1Q5TGL8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PXDC1Q5TGL8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PXDC1Q5TGL8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PXDC1Q5TGL8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PXDC1Q5TGL8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PXDC1Q5TGL8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PXDC1Q5TGL8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PXDC1Q5TGL8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PXDC1Q5TGL8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PXDC1Q5TGL8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PXDC1Q5TGL8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PXDC1Q5TGL8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PXDC1Q5TGL8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PXDC1Q5TGL8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PXDC1Q5TGL8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PXDC1Q5TGL8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PXDC1Q5TGL8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PXDC1Q5TGL8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PXDC1Q5TGL8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PXDC1Q5TGL8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PXDC1Q5TGL8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PXDC1Q5TGL8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PXDC1Q5TGL8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PXDC1Q5TGL8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PXDC1Q5TGL8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PXDC1Q5TGL8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PXDC1Q5TGL8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PXDC1Q5TGL8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PXDC1Q5TGL8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PXDC1Q5TGL8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PXDC1Q5TGL8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PXDC1Q5TGL8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PXDC1Q5TGL8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PXDC1Q5TGL8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PXDC1Q5TGL8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PXDC1Q5TGL8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PXDC1Q5TGL8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PXDC1Q5TGL8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PXDC1Q5TGL8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PXDC1Q5TGL8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PXDC1Q5TGL8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PXDC1Q5TGL8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PXDC1Q5TGL8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PXDC1Q5TGL8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PXDC1Q5TGL8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PXDC1Q5TGL8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PXDC1Q5TGL8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PXDC1Q5TGL8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PXDC1Q5TGL8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PXDC1Q5TGL8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PXDC1Q5TGL8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PXDC1Q5TGL8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PXDC1Q5TGL8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PXDC1Q5TGL8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PXDC1Q5TGL8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PXDC1Q5TGL8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PXDC1Q5TGL8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PXDC1Q5TGL8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PXDC1Q5TGL8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PXDC1Q5TGL8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PXDC1Q5TGL8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PXDC1Q5TGL8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PXDC1Q5TGL8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
PXDC1Q5TGL8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PXDC1Q5TGL8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms