Protein–RNA interactions for Protein: Q5TCQ9

MAGI3, Membrane-associated guanylate kinase, WW and PDZ domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGI3Q5TCQ9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC40.74■■■■■ 4.11
MAGI3Q5TCQ9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
MAGI3Q5TCQ9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
MAGI3Q5TCQ9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC40.73■■■■■ 4.11
MAGI3Q5TCQ9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC40.72■■■■■ 4.11
MAGI3Q5TCQ9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
MAGI3Q5TCQ9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
MAGI3Q5TCQ9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC40.72■■■■■ 4.11
MAGI3Q5TCQ9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
MAGI3Q5TCQ9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC40.69■■■■■ 4.1
MAGI3Q5TCQ9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
MAGI3Q5TCQ9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
MAGI3Q5TCQ9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
MAGI3Q5TCQ9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
MAGI3Q5TCQ9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
MAGI3Q5TCQ9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
MAGI3Q5TCQ9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC40.65■■■■■ 4.1
MAGI3Q5TCQ9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC40.64■■■■■ 4.1
MAGI3Q5TCQ9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC40.64■■■■■ 4.1
MAGI3Q5TCQ9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
MAGI3Q5TCQ9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
MAGI3Q5TCQ9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC40.61■■■■■ 4.09
MAGI3Q5TCQ9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC40.61■■■■■ 4.09
MAGI3Q5TCQ9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC40.61■■■■■ 4.09
MAGI3Q5TCQ9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
MAGI3Q5TCQ9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
MAGI3Q5TCQ9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC40.59■■■■■ 4.09
MAGI3Q5TCQ9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.58■■■■■ 4.09
MAGI3Q5TCQ9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.58■■■■■ 4.09
MAGI3Q5TCQ9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.57■■■■■ 4.09
MAGI3Q5TCQ9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
MAGI3Q5TCQ9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC40.57■■■■■ 4.08
MAGI3Q5TCQ9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
MAGI3Q5TCQ9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC40.52■■■■■ 4.08
MAGI3Q5TCQ9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
MAGI3Q5TCQ9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC40.52■■■■■ 4.08
MAGI3Q5TCQ9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC40.51■■■■■ 4.08
MAGI3Q5TCQ9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.08
MAGI3Q5TCQ9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
MAGI3Q5TCQ9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
MAGI3Q5TCQ9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
MAGI3Q5TCQ9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
MAGI3Q5TCQ9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC40.49■■■■■ 4.07
MAGI3Q5TCQ9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC40.49■■■■■ 4.07
MAGI3Q5TCQ9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
MAGI3Q5TCQ9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC40.47■■■■■ 4.07
MAGI3Q5TCQ9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC40.47■■■■■ 4.07
MAGI3Q5TCQ9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC40.47■■■■■ 4.07
MAGI3Q5TCQ9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
MAGI3Q5TCQ9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
MAGI3Q5TCQ9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC40.45■■■■■ 4.07
MAGI3Q5TCQ9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
MAGI3Q5TCQ9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
MAGI3Q5TCQ9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
MAGI3Q5TCQ9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
MAGI3Q5TCQ9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.43■■■■■ 4.06
MAGI3Q5TCQ9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
MAGI3Q5TCQ9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC40.43■■■■■ 4.06
MAGI3Q5TCQ9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
MAGI3Q5TCQ9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
MAGI3Q5TCQ9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
MAGI3Q5TCQ9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
MAGI3Q5TCQ9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
MAGI3Q5TCQ9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
MAGI3Q5TCQ9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
MAGI3Q5TCQ9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC40.39■■■■■ 4.06
MAGI3Q5TCQ9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC40.39■■■■■ 4.06
MAGI3Q5TCQ9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
MAGI3Q5TCQ9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
MAGI3Q5TCQ9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC40.38■■■■■ 4.06
MAGI3Q5TCQ9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC40.38■■■■■ 4.06
MAGI3Q5TCQ9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC40.38■■■■■ 4.05
MAGI3Q5TCQ9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC40.38■■■■■ 4.05
MAGI3Q5TCQ9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC40.37■■■■■ 4.05
MAGI3Q5TCQ9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC40.37■■■■■ 4.05
MAGI3Q5TCQ9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
MAGI3Q5TCQ9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC40.37■■■■■ 4.05
MAGI3Q5TCQ9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC40.37■■■■■ 4.05
MAGI3Q5TCQ9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.37■■■■■ 4.05
MAGI3Q5TCQ9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
MAGI3Q5TCQ9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC40.36■■■■■ 4.05
MAGI3Q5TCQ9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
MAGI3Q5TCQ9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
MAGI3Q5TCQ9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
MAGI3Q5TCQ9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
MAGI3Q5TCQ9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.32■■■■■ 4.05
MAGI3Q5TCQ9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
MAGI3Q5TCQ9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC40.32■■■■■ 4.04
MAGI3Q5TCQ9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC40.32■■■■■ 4.04
MAGI3Q5TCQ9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC40.32■■■■■ 4.04
MAGI3Q5TCQ9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
MAGI3Q5TCQ9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC40.3■■■■■ 4.04
MAGI3Q5TCQ9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC40.3■■■■■ 4.04
MAGI3Q5TCQ9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC40.3■■■■■ 4.04
MAGI3Q5TCQ9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
MAGI3Q5TCQ9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC40.27■■■■■ 4.04
MAGI3Q5TCQ9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.27■■■■■ 4.04
MAGI3Q5TCQ9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.26■■■■■ 4.04
MAGI3Q5TCQ9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.24■■■■■ 4.03
MAGI3Q5TCQ9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC40.22■■■■■ 4.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms