Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P6

TMEM78, Transmembrane protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM78Q5T7P6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMEM78Q5T7P6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMEM78Q5T7P6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMEM78Q5T7P6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMEM78Q5T7P6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMEM78Q5T7P6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMEM78Q5T7P6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMEM78Q5T7P6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMEM78Q5T7P6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMEM78Q5T7P6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TMEM78Q5T7P6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMEM78Q5T7P6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMEM78Q5T7P6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMEM78Q5T7P6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMEM78Q5T7P6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMEM78Q5T7P6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM78Q5T7P6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM78Q5T7P6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM78Q5T7P6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM78Q5T7P6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM78Q5T7P6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM78Q5T7P6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM78Q5T7P6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM78Q5T7P6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM78Q5T7P6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM78Q5T7P6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM78Q5T7P6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM78Q5T7P6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM78Q5T7P6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM78Q5T7P6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM78Q5T7P6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM78Q5T7P6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM78Q5T7P6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM78Q5T7P6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM78Q5T7P6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM78Q5T7P6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM78Q5T7P6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM78Q5T7P6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM78Q5T7P6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM78Q5T7P6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM78Q5T7P6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM78Q5T7P6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM78Q5T7P6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM78Q5T7P6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM78Q5T7P6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM78Q5T7P6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM78Q5T7P6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM78Q5T7P6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM78Q5T7P6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM78Q5T7P6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM78Q5T7P6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM78Q5T7P6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TMEM78Q5T7P6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM78Q5T7P6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM78Q5T7P6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM78Q5T7P6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM78Q5T7P6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM78Q5T7P6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM78Q5T7P6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM78Q5T7P6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM78Q5T7P6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM78Q5T7P6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM78Q5T7P6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM78Q5T7P6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM78Q5T7P6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM78Q5T7P6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM78Q5T7P6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM78Q5T7P6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM78Q5T7P6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM78Q5T7P6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM78Q5T7P6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM78Q5T7P6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM78Q5T7P6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM78Q5T7P6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM78Q5T7P6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM78Q5T7P6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM78Q5T7P6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM78Q5T7P6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM78Q5T7P6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM78Q5T7P6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM78Q5T7P6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM78Q5T7P6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM78Q5T7P6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM78Q5T7P6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM78Q5T7P6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM78Q5T7P6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM78Q5T7P6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM78Q5T7P6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM78Q5T7P6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMEM78Q5T7P6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMEM78Q5T7P6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMEM78Q5T7P6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM78Q5T7P6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM78Q5T7P6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM78Q5T7P6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM78Q5T7P6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM78Q5T7P6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM78Q5T7P6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM78Q5T7P6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM78Q5T7P6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms