Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5J6

SWT1, Transcriptional protein SWT1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWT1Q5T5J6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SWT1Q5T5J6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SWT1Q5T5J6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SWT1Q5T5J6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SWT1Q5T5J6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SWT1Q5T5J6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SWT1Q5T5J6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SWT1Q5T5J6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SWT1Q5T5J6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SWT1Q5T5J6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SWT1Q5T5J6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SWT1Q5T5J6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SWT1Q5T5J6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SWT1Q5T5J6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SWT1Q5T5J6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SWT1Q5T5J6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SWT1Q5T5J6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SWT1Q5T5J6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SWT1Q5T5J6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SWT1Q5T5J6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SWT1Q5T5J6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SWT1Q5T5J6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SWT1Q5T5J6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SWT1Q5T5J6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SWT1Q5T5J6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SWT1Q5T5J6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SWT1Q5T5J6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SWT1Q5T5J6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SWT1Q5T5J6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SWT1Q5T5J6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SWT1Q5T5J6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SWT1Q5T5J6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SWT1Q5T5J6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SWT1Q5T5J6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SWT1Q5T5J6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SWT1Q5T5J6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SWT1Q5T5J6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SWT1Q5T5J6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SWT1Q5T5J6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SWT1Q5T5J6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SWT1Q5T5J6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SWT1Q5T5J6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SWT1Q5T5J6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SWT1Q5T5J6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SWT1Q5T5J6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SWT1Q5T5J6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SWT1Q5T5J6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SWT1Q5T5J6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SWT1Q5T5J6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SWT1Q5T5J6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SWT1Q5T5J6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SWT1Q5T5J6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SWT1Q5T5J6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SWT1Q5T5J6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SWT1Q5T5J6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SWT1Q5T5J6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SWT1Q5T5J6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SWT1Q5T5J6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SWT1Q5T5J6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SWT1Q5T5J6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SWT1Q5T5J6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SWT1Q5T5J6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SWT1Q5T5J6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SWT1Q5T5J6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SWT1Q5T5J6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SWT1Q5T5J6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SWT1Q5T5J6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SWT1Q5T5J6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SWT1Q5T5J6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SWT1Q5T5J6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SWT1Q5T5J6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SWT1Q5T5J6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SWT1Q5T5J6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SWT1Q5T5J6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SWT1Q5T5J6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SWT1Q5T5J6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SWT1Q5T5J6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SWT1Q5T5J6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SWT1Q5T5J6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SWT1Q5T5J6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SWT1Q5T5J6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SWT1Q5T5J6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SWT1Q5T5J6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SWT1Q5T5J6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SWT1Q5T5J6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SWT1Q5T5J6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SWT1Q5T5J6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SWT1Q5T5J6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SWT1Q5T5J6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SWT1Q5T5J6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SWT1Q5T5J6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SWT1Q5T5J6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SWT1Q5T5J6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SWT1Q5T5J6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SWT1Q5T5J6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SWT1Q5T5J6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SWT1Q5T5J6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SWT1Q5T5J6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SWT1Q5T5J6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SWT1Q5T5J6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms