Protein–RNA interactions for Protein: Q5JS37

NHLRC3, NHL repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC3Q5JS37 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NHLRC3Q5JS37 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NHLRC3Q5JS37 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NHLRC3Q5JS37 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NHLRC3Q5JS37 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NHLRC3Q5JS37 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NHLRC3Q5JS37 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NHLRC3Q5JS37 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NHLRC3Q5JS37 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NHLRC3Q5JS37 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NHLRC3Q5JS37 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NHLRC3Q5JS37 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NHLRC3Q5JS37 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NHLRC3Q5JS37 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NHLRC3Q5JS37 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NHLRC3Q5JS37 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NHLRC3Q5JS37 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NHLRC3Q5JS37 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NHLRC3Q5JS37 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NHLRC3Q5JS37 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NHLRC3Q5JS37 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NHLRC3Q5JS37 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NHLRC3Q5JS37 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NHLRC3Q5JS37 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NHLRC3Q5JS37 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NHLRC3Q5JS37 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NHLRC3Q5JS37 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NHLRC3Q5JS37 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NHLRC3Q5JS37 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NHLRC3Q5JS37 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NHLRC3Q5JS37 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NHLRC3Q5JS37 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NHLRC3Q5JS37 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NHLRC3Q5JS37 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NHLRC3Q5JS37 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NHLRC3Q5JS37 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NHLRC3Q5JS37 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NHLRC3Q5JS37 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NHLRC3Q5JS37 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NHLRC3Q5JS37 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NHLRC3Q5JS37 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NHLRC3Q5JS37 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NHLRC3Q5JS37 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NHLRC3Q5JS37 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NHLRC3Q5JS37 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NHLRC3Q5JS37 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NHLRC3Q5JS37 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NHLRC3Q5JS37 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NHLRC3Q5JS37 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NHLRC3Q5JS37 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NHLRC3Q5JS37 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NHLRC3Q5JS37 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NHLRC3Q5JS37 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NHLRC3Q5JS37 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NHLRC3Q5JS37 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NHLRC3Q5JS37 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NHLRC3Q5JS37 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NHLRC3Q5JS37 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NHLRC3Q5JS37 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NHLRC3Q5JS37 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NHLRC3Q5JS37 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NHLRC3Q5JS37 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NHLRC3Q5JS37 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NHLRC3Q5JS37 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NHLRC3Q5JS37 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NHLRC3Q5JS37 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NHLRC3Q5JS37 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NHLRC3Q5JS37 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NHLRC3Q5JS37 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NHLRC3Q5JS37 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NHLRC3Q5JS37 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NHLRC3Q5JS37 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NHLRC3Q5JS37 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NHLRC3Q5JS37 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NHLRC3Q5JS37 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NHLRC3Q5JS37 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NHLRC3Q5JS37 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NHLRC3Q5JS37 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NHLRC3Q5JS37 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NHLRC3Q5JS37 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NHLRC3Q5JS37 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NHLRC3Q5JS37 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NHLRC3Q5JS37 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NHLRC3Q5JS37 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NHLRC3Q5JS37 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NHLRC3Q5JS37 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NHLRC3Q5JS37 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NHLRC3Q5JS37 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NHLRC3Q5JS37 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NHLRC3Q5JS37 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NHLRC3Q5JS37 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NHLRC3Q5JS37 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NHLRC3Q5JS37 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NHLRC3Q5JS37 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NHLRC3Q5JS37 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NHLRC3Q5JS37 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NHLRC3Q5JS37 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NHLRC3Q5JS37 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NHLRC3Q5JS37 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NHLRC3Q5JS37 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms