Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HERC4Q5GLZ8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HERC4Q5GLZ8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HERC4Q5GLZ8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HERC4Q5GLZ8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HERC4Q5GLZ8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
HERC4Q5GLZ8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HERC4Q5GLZ8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
HERC4Q5GLZ8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HERC4Q5GLZ8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HERC4Q5GLZ8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HERC4Q5GLZ8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HERC4Q5GLZ8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HERC4Q5GLZ8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HERC4Q5GLZ8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HERC4Q5GLZ8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HERC4Q5GLZ8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HERC4Q5GLZ8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HERC4Q5GLZ8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HERC4Q5GLZ8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HERC4Q5GLZ8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HERC4Q5GLZ8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HERC4Q5GLZ8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HERC4Q5GLZ8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HERC4Q5GLZ8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HERC4Q5GLZ8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HERC4Q5GLZ8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HERC4Q5GLZ8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HERC4Q5GLZ8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HERC4Q5GLZ8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HERC4Q5GLZ8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HERC4Q5GLZ8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HERC4Q5GLZ8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HERC4Q5GLZ8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HERC4Q5GLZ8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HERC4Q5GLZ8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HERC4Q5GLZ8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HERC4Q5GLZ8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HERC4Q5GLZ8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HERC4Q5GLZ8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HERC4Q5GLZ8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HERC4Q5GLZ8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HERC4Q5GLZ8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HERC4Q5GLZ8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HERC4Q5GLZ8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HERC4Q5GLZ8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
HERC4Q5GLZ8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HERC4Q5GLZ8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
HERC4Q5GLZ8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
HERC4Q5GLZ8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HERC4Q5GLZ8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HERC4Q5GLZ8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HERC4Q5GLZ8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HERC4Q5GLZ8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HERC4Q5GLZ8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
HERC4Q5GLZ8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
HERC4Q5GLZ8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HERC4Q5GLZ8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HERC4Q5GLZ8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
HERC4Q5GLZ8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HERC4Q5GLZ8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
HERC4Q5GLZ8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HERC4Q5GLZ8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HERC4Q5GLZ8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
HERC4Q5GLZ8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HERC4Q5GLZ8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
HERC4Q5GLZ8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
HERC4Q5GLZ8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HERC4Q5GLZ8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HERC4Q5GLZ8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HERC4Q5GLZ8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
HERC4Q5GLZ8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
HERC4Q5GLZ8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HERC4Q5GLZ8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HERC4Q5GLZ8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HERC4Q5GLZ8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HERC4Q5GLZ8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HERC4Q5GLZ8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HERC4Q5GLZ8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HERC4Q5GLZ8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HERC4Q5GLZ8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HERC4Q5GLZ8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HERC4Q5GLZ8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HERC4Q5GLZ8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HERC4Q5GLZ8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HERC4Q5GLZ8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HERC4Q5GLZ8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HERC4Q5GLZ8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HERC4Q5GLZ8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HERC4Q5GLZ8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HERC4Q5GLZ8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HERC4Q5GLZ8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HERC4Q5GLZ8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
HERC4Q5GLZ8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
HERC4Q5GLZ8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
HERC4Q5GLZ8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
HERC4Q5GLZ8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
HERC4Q5GLZ8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HERC4Q5GLZ8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HERC4Q5GLZ8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms