Protein–RNA interactions for Protein: Q58A45

PAN3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit PAN3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN3Q58A45 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAN3Q58A45 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAN3Q58A45 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAN3Q58A45 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAN3Q58A45 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAN3Q58A45 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAN3Q58A45 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAN3Q58A45 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAN3Q58A45 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PAN3Q58A45 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAN3Q58A45 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAN3Q58A45 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAN3Q58A45 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PAN3Q58A45 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAN3Q58A45 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAN3Q58A45 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PAN3Q58A45 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PAN3Q58A45 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PAN3Q58A45 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PAN3Q58A45 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PAN3Q58A45 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PAN3Q58A45 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PAN3Q58A45 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PAN3Q58A45 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PAN3Q58A45 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAN3Q58A45 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAN3Q58A45 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PAN3Q58A45 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAN3Q58A45 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAN3Q58A45 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAN3Q58A45 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAN3Q58A45 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAN3Q58A45 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PAN3Q58A45 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAN3Q58A45 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAN3Q58A45 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAN3Q58A45 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAN3Q58A45 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAN3Q58A45 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAN3Q58A45 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAN3Q58A45 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAN3Q58A45 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAN3Q58A45 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAN3Q58A45 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAN3Q58A45 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAN3Q58A45 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAN3Q58A45 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAN3Q58A45 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAN3Q58A45 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAN3Q58A45 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAN3Q58A45 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAN3Q58A45 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PAN3Q58A45 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PAN3Q58A45 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PAN3Q58A45 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PAN3Q58A45 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PAN3Q58A45 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PAN3Q58A45 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAN3Q58A45 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAN3Q58A45 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAN3Q58A45 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAN3Q58A45 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAN3Q58A45 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAN3Q58A45 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAN3Q58A45 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAN3Q58A45 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAN3Q58A45 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAN3Q58A45 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAN3Q58A45 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PAN3Q58A45 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAN3Q58A45 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAN3Q58A45 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAN3Q58A45 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAN3Q58A45 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAN3Q58A45 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAN3Q58A45 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAN3Q58A45 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAN3Q58A45 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAN3Q58A45 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAN3Q58A45 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PAN3Q58A45 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PAN3Q58A45 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PAN3Q58A45 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PAN3Q58A45 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PAN3Q58A45 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAN3Q58A45 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAN3Q58A45 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAN3Q58A45 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAN3Q58A45 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PAN3Q58A45 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PAN3Q58A45 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PAN3Q58A45 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PAN3Q58A45 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PAN3Q58A45 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PAN3Q58A45 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PAN3Q58A45 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PAN3Q58A45 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAN3Q58A45 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAN3Q58A45 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAN3Q58A45 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.3 ms