Protein–RNA interactions for Protein: Q49AR2

C5orf22, UPF0489 protein C5orf22, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf22Q49AR2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
C5orf22Q49AR2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
C5orf22Q49AR2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
C5orf22Q49AR2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
C5orf22Q49AR2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
C5orf22Q49AR2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
C5orf22Q49AR2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
C5orf22Q49AR2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
C5orf22Q49AR2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
C5orf22Q49AR2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
C5orf22Q49AR2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
C5orf22Q49AR2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
C5orf22Q49AR2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
C5orf22Q49AR2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
C5orf22Q49AR2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
C5orf22Q49AR2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
C5orf22Q49AR2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
C5orf22Q49AR2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
C5orf22Q49AR2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
C5orf22Q49AR2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
C5orf22Q49AR2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
C5orf22Q49AR2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
C5orf22Q49AR2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
C5orf22Q49AR2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
C5orf22Q49AR2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
C5orf22Q49AR2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
C5orf22Q49AR2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
C5orf22Q49AR2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
C5orf22Q49AR2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
C5orf22Q49AR2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
C5orf22Q49AR2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
C5orf22Q49AR2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
C5orf22Q49AR2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
C5orf22Q49AR2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
C5orf22Q49AR2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
C5orf22Q49AR2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
C5orf22Q49AR2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
C5orf22Q49AR2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
C5orf22Q49AR2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
C5orf22Q49AR2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
C5orf22Q49AR2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
C5orf22Q49AR2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
C5orf22Q49AR2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
C5orf22Q49AR2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
C5orf22Q49AR2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
C5orf22Q49AR2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
C5orf22Q49AR2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
C5orf22Q49AR2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
C5orf22Q49AR2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
C5orf22Q49AR2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
C5orf22Q49AR2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
C5orf22Q49AR2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
C5orf22Q49AR2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
C5orf22Q49AR2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
C5orf22Q49AR2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
C5orf22Q49AR2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
C5orf22Q49AR2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
C5orf22Q49AR2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
C5orf22Q49AR2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
C5orf22Q49AR2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
C5orf22Q49AR2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
C5orf22Q49AR2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
C5orf22Q49AR2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
C5orf22Q49AR2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
C5orf22Q49AR2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
C5orf22Q49AR2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
C5orf22Q49AR2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
C5orf22Q49AR2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
C5orf22Q49AR2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
C5orf22Q49AR2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
C5orf22Q49AR2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
C5orf22Q49AR2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
C5orf22Q49AR2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
C5orf22Q49AR2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
C5orf22Q49AR2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
C5orf22Q49AR2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
C5orf22Q49AR2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
C5orf22Q49AR2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
C5orf22Q49AR2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
C5orf22Q49AR2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
C5orf22Q49AR2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
C5orf22Q49AR2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
C5orf22Q49AR2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
C5orf22Q49AR2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
C5orf22Q49AR2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
C5orf22Q49AR2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
C5orf22Q49AR2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
C5orf22Q49AR2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
C5orf22Q49AR2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
C5orf22Q49AR2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
C5orf22Q49AR2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
C5orf22Q49AR2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
C5orf22Q49AR2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
C5orf22Q49AR2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
C5orf22Q49AR2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
C5orf22Q49AR2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
C5orf22Q49AR2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
C5orf22Q49AR2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
C5orf22Q49AR2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
C5orf22Q49AR2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms