Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY46

KRTAP13-3, Keratin-associated protein 13-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-3Q3SY46 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KRTAP13-3Q3SY46 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KRTAP13-3Q3SY46 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KRTAP13-3Q3SY46 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KRTAP13-3Q3SY46 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KRTAP13-3Q3SY46 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KRTAP13-3Q3SY46 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KRTAP13-3Q3SY46 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KRTAP13-3Q3SY46 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KRTAP13-3Q3SY46 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KRTAP13-3Q3SY46 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KRTAP13-3Q3SY46 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KRTAP13-3Q3SY46 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KRTAP13-3Q3SY46 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KRTAP13-3Q3SY46 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KRTAP13-3Q3SY46 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KRTAP13-3Q3SY46 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KRTAP13-3Q3SY46 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KRTAP13-3Q3SY46 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
KRTAP13-3Q3SY46 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KRTAP13-3Q3SY46 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KRTAP13-3Q3SY46 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KRTAP13-3Q3SY46 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KRTAP13-3Q3SY46 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KRTAP13-3Q3SY46 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KRTAP13-3Q3SY46 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KRTAP13-3Q3SY46 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KRTAP13-3Q3SY46 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
KRTAP13-3Q3SY46 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
KRTAP13-3Q3SY46 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
KRTAP13-3Q3SY46 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KRTAP13-3Q3SY46 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KRTAP13-3Q3SY46 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KRTAP13-3Q3SY46 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP13-3Q3SY46 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP13-3Q3SY46 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP13-3Q3SY46 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP13-3Q3SY46 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP13-3Q3SY46 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP13-3Q3SY46 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP13-3Q3SY46 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP13-3Q3SY46 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP13-3Q3SY46 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP13-3Q3SY46 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRTAP13-3Q3SY46 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
KRTAP13-3Q3SY46 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRTAP13-3Q3SY46 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRTAP13-3Q3SY46 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRTAP13-3Q3SY46 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRTAP13-3Q3SY46 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRTAP13-3Q3SY46 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRTAP13-3Q3SY46 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRTAP13-3Q3SY46 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRTAP13-3Q3SY46 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
KRTAP13-3Q3SY46 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
KRTAP13-3Q3SY46 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
KRTAP13-3Q3SY46 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
KRTAP13-3Q3SY46 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
KRTAP13-3Q3SY46 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
KRTAP13-3Q3SY46 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
KRTAP13-3Q3SY46 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
KRTAP13-3Q3SY46 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
KRTAP13-3Q3SY46 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
KRTAP13-3Q3SY46 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
KRTAP13-3Q3SY46 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
KRTAP13-3Q3SY46 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KRTAP13-3Q3SY46 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KRTAP13-3Q3SY46 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
KRTAP13-3Q3SY46 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KRTAP13-3Q3SY46 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
KRTAP13-3Q3SY46 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
KRTAP13-3Q3SY46 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
KRTAP13-3Q3SY46 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
KRTAP13-3Q3SY46 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
KRTAP13-3Q3SY46 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
KRTAP13-3Q3SY46 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
KRTAP13-3Q3SY46 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
KRTAP13-3Q3SY46 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
KRTAP13-3Q3SY46 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
KRTAP13-3Q3SY46 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
KRTAP13-3Q3SY46 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
KRTAP13-3Q3SY46 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
KRTAP13-3Q3SY46 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
KRTAP13-3Q3SY46 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
KRTAP13-3Q3SY46 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
KRTAP13-3Q3SY46 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
KRTAP13-3Q3SY46 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
KRTAP13-3Q3SY46 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
KRTAP13-3Q3SY46 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
KRTAP13-3Q3SY46 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
KRTAP13-3Q3SY46 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
KRTAP13-3Q3SY46 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
KRTAP13-3Q3SY46 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
KRTAP13-3Q3SY46 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
KRTAP13-3Q3SY46 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
KRTAP13-3Q3SY46 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
KRTAP13-3Q3SY46 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
KRTAP13-3Q3SY46 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
KRTAP13-3Q3SY46 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
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