Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCGF3Q3KNV8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCGF3Q3KNV8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCGF3Q3KNV8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCGF3Q3KNV8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PCGF3Q3KNV8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PCGF3Q3KNV8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCGF3Q3KNV8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCGF3Q3KNV8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCGF3Q3KNV8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCGF3Q3KNV8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PCGF3Q3KNV8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCGF3Q3KNV8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCGF3Q3KNV8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCGF3Q3KNV8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PCGF3Q3KNV8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCGF3Q3KNV8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCGF3Q3KNV8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCGF3Q3KNV8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCGF3Q3KNV8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCGF3Q3KNV8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCGF3Q3KNV8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCGF3Q3KNV8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCGF3Q3KNV8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCGF3Q3KNV8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCGF3Q3KNV8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCGF3Q3KNV8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCGF3Q3KNV8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCGF3Q3KNV8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCGF3Q3KNV8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCGF3Q3KNV8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCGF3Q3KNV8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCGF3Q3KNV8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCGF3Q3KNV8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCGF3Q3KNV8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCGF3Q3KNV8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PCGF3Q3KNV8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCGF3Q3KNV8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCGF3Q3KNV8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCGF3Q3KNV8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCGF3Q3KNV8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCGF3Q3KNV8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCGF3Q3KNV8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCGF3Q3KNV8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCGF3Q3KNV8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PCGF3Q3KNV8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PCGF3Q3KNV8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCGF3Q3KNV8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCGF3Q3KNV8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCGF3Q3KNV8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCGF3Q3KNV8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCGF3Q3KNV8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCGF3Q3KNV8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCGF3Q3KNV8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCGF3Q3KNV8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCGF3Q3KNV8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCGF3Q3KNV8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCGF3Q3KNV8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCGF3Q3KNV8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCGF3Q3KNV8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCGF3Q3KNV8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCGF3Q3KNV8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCGF3Q3KNV8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCGF3Q3KNV8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCGF3Q3KNV8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCGF3Q3KNV8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCGF3Q3KNV8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCGF3Q3KNV8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCGF3Q3KNV8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCGF3Q3KNV8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCGF3Q3KNV8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCGF3Q3KNV8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCGF3Q3KNV8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCGF3Q3KNV8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCGF3Q3KNV8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCGF3Q3KNV8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCGF3Q3KNV8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCGF3Q3KNV8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCGF3Q3KNV8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCGF3Q3KNV8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCGF3Q3KNV8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCGF3Q3KNV8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCGF3Q3KNV8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCGF3Q3KNV8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PCGF3Q3KNV8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PCGF3Q3KNV8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCGF3Q3KNV8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCGF3Q3KNV8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCGF3Q3KNV8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCGF3Q3KNV8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCGF3Q3KNV8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCGF3Q3KNV8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCGF3Q3KNV8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCGF3Q3KNV8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCGF3Q3KNV8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PCGF3Q3KNV8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PCGF3Q3KNV8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PCGF3Q3KNV8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PCGF3Q3KNV8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCGF3Q3KNV8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms