Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
KLHL40Q2TBA0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
KLHL40Q2TBA0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KLHL40Q2TBA0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
KLHL40Q2TBA0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KLHL40Q2TBA0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
KLHL40Q2TBA0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
KLHL40Q2TBA0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
KLHL40Q2TBA0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KLHL40Q2TBA0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KLHL40Q2TBA0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KLHL40Q2TBA0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KLHL40Q2TBA0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KLHL40Q2TBA0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KLHL40Q2TBA0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KLHL40Q2TBA0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KLHL40Q2TBA0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
KLHL40Q2TBA0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
KLHL40Q2TBA0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
KLHL40Q2TBA0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
KLHL40Q2TBA0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
KLHL40Q2TBA0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
KLHL40Q2TBA0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KLHL40Q2TBA0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
KLHL40Q2TBA0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
KLHL40Q2TBA0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
KLHL40Q2TBA0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
KLHL40Q2TBA0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
KLHL40Q2TBA0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
KLHL40Q2TBA0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
KLHL40Q2TBA0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
KLHL40Q2TBA0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
KLHL40Q2TBA0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
KLHL40Q2TBA0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
KLHL40Q2TBA0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
KLHL40Q2TBA0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
KLHL40Q2TBA0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
KLHL40Q2TBA0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
KLHL40Q2TBA0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
KLHL40Q2TBA0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
KLHL40Q2TBA0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
KLHL40Q2TBA0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
KLHL40Q2TBA0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
KLHL40Q2TBA0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
KLHL40Q2TBA0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
KLHL40Q2TBA0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
KLHL40Q2TBA0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
KLHL40Q2TBA0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
KLHL40Q2TBA0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KLHL40Q2TBA0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KLHL40Q2TBA0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KLHL40Q2TBA0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KLHL40Q2TBA0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
KLHL40Q2TBA0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KLHL40Q2TBA0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
KLHL40Q2TBA0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
KLHL40Q2TBA0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KLHL40Q2TBA0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KLHL40Q2TBA0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KLHL40Q2TBA0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KLHL40Q2TBA0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KLHL40Q2TBA0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
KLHL40Q2TBA0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
KLHL40Q2TBA0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KLHL40Q2TBA0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KLHL40Q2TBA0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KLHL40Q2TBA0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KLHL40Q2TBA0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KLHL40Q2TBA0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KLHL40Q2TBA0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
KLHL40Q2TBA0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
KLHL40Q2TBA0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
KLHL40Q2TBA0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KLHL40Q2TBA0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
KLHL40Q2TBA0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KLHL40Q2TBA0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
KLHL40Q2TBA0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
KLHL40Q2TBA0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
KLHL40Q2TBA0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KLHL40Q2TBA0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
KLHL40Q2TBA0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KLHL40Q2TBA0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
KLHL40Q2TBA0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
KLHL40Q2TBA0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KLHL40Q2TBA0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KLHL40Q2TBA0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KLHL40Q2TBA0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KLHL40Q2TBA0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
KLHL40Q2TBA0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KLHL40Q2TBA0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KLHL40Q2TBA0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
KLHL40Q2TBA0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
KLHL40Q2TBA0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
KLHL40Q2TBA0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
KLHL40Q2TBA0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
KLHL40Q2TBA0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
KLHL40Q2TBA0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KLHL40Q2TBA0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
KLHL40Q2TBA0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KLHL40Q2TBA0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms