Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
COL24A1Q17RW2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
COL24A1Q17RW2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
COL24A1Q17RW2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
COL24A1Q17RW2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
COL24A1Q17RW2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
COL24A1Q17RW2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.89
COL24A1Q17RW2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.89
COL24A1Q17RW2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
COL24A1Q17RW2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
COL24A1Q17RW2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
COL24A1Q17RW2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
COL24A1Q17RW2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
COL24A1Q17RW2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
COL24A1Q17RW2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
COL24A1Q17RW2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
COL24A1Q17RW2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
COL24A1Q17RW2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
COL24A1Q17RW2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
COL24A1Q17RW2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
COL24A1Q17RW2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
COL24A1Q17RW2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
COL24A1Q17RW2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
COL24A1Q17RW2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
COL24A1Q17RW2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
COL24A1Q17RW2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
COL24A1Q17RW2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
COL24A1Q17RW2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
COL24A1Q17RW2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
COL24A1Q17RW2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
COL24A1Q17RW2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
COL24A1Q17RW2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
COL24A1Q17RW2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
COL24A1Q17RW2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
COL24A1Q17RW2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
COL24A1Q17RW2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
COL24A1Q17RW2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC33.01■■■□□ 2.88
COL24A1Q17RW2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
COL24A1Q17RW2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
COL24A1Q17RW2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
COL24A1Q17RW2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
COL24A1Q17RW2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
COL24A1Q17RW2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
COL24A1Q17RW2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
COL24A1Q17RW2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
COL24A1Q17RW2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
COL24A1Q17RW2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
COL24A1Q17RW2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
COL24A1Q17RW2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
COL24A1Q17RW2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
COL24A1Q17RW2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
COL24A1Q17RW2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
COL24A1Q17RW2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
COL24A1Q17RW2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
COL24A1Q17RW2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
COL24A1Q17RW2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
COL24A1Q17RW2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
COL24A1Q17RW2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
COL24A1Q17RW2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
COL24A1Q17RW2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
COL24A1Q17RW2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
COL24A1Q17RW2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
COL24A1Q17RW2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
COL24A1Q17RW2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
COL24A1Q17RW2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
COL24A1Q17RW2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
COL24A1Q17RW2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
COL24A1Q17RW2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC32.91■■■□□ 2.86
COL24A1Q17RW2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
COL24A1Q17RW2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
COL24A1Q17RW2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
COL24A1Q17RW2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
COL24A1Q17RW2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
COL24A1Q17RW2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
COL24A1Q17RW2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
COL24A1Q17RW2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
COL24A1Q17RW2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
COL24A1Q17RW2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
COL24A1Q17RW2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
COL24A1Q17RW2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
COL24A1Q17RW2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC32.86■■■□□ 2.85
COL24A1Q17RW2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
COL24A1Q17RW2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
COL24A1Q17RW2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
COL24A1Q17RW2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
COL24A1Q17RW2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC32.83■■■□□ 2.85
COL24A1Q17RW2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
COL24A1Q17RW2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
COL24A1Q17RW2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
COL24A1Q17RW2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
COL24A1Q17RW2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
COL24A1Q17RW2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
COL24A1Q17RW2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
COL24A1Q17RW2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
COL24A1Q17RW2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
COL24A1Q17RW2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
COL24A1Q17RW2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
COL24A1Q17RW2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
COL24A1Q17RW2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
COL24A1Q17RW2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
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