Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GEN1Q17RS7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GEN1Q17RS7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GEN1Q17RS7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GEN1Q17RS7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GEN1Q17RS7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GEN1Q17RS7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GEN1Q17RS7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GEN1Q17RS7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GEN1Q17RS7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GEN1Q17RS7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GEN1Q17RS7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GEN1Q17RS7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GEN1Q17RS7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GEN1Q17RS7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GEN1Q17RS7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GEN1Q17RS7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GEN1Q17RS7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GEN1Q17RS7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GEN1Q17RS7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GEN1Q17RS7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GEN1Q17RS7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
GEN1Q17RS7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
GEN1Q17RS7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GEN1Q17RS7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GEN1Q17RS7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GEN1Q17RS7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GEN1Q17RS7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GEN1Q17RS7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GEN1Q17RS7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GEN1Q17RS7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GEN1Q17RS7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GEN1Q17RS7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GEN1Q17RS7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GEN1Q17RS7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GEN1Q17RS7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GEN1Q17RS7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GEN1Q17RS7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GEN1Q17RS7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GEN1Q17RS7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GEN1Q17RS7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GEN1Q17RS7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GEN1Q17RS7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GEN1Q17RS7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GEN1Q17RS7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GEN1Q17RS7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GEN1Q17RS7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GEN1Q17RS7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GEN1Q17RS7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GEN1Q17RS7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GEN1Q17RS7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
GEN1Q17RS7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GEN1Q17RS7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
GEN1Q17RS7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GEN1Q17RS7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GEN1Q17RS7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GEN1Q17RS7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
GEN1Q17RS7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GEN1Q17RS7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GEN1Q17RS7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GEN1Q17RS7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GEN1Q17RS7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GEN1Q17RS7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GEN1Q17RS7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GEN1Q17RS7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GEN1Q17RS7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GEN1Q17RS7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GEN1Q17RS7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GEN1Q17RS7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GEN1Q17RS7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GEN1Q17RS7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GEN1Q17RS7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GEN1Q17RS7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GEN1Q17RS7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GEN1Q17RS7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GEN1Q17RS7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GEN1Q17RS7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GEN1Q17RS7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GEN1Q17RS7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GEN1Q17RS7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GEN1Q17RS7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GEN1Q17RS7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GEN1Q17RS7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GEN1Q17RS7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GEN1Q17RS7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GEN1Q17RS7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GEN1Q17RS7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GEN1Q17RS7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GEN1Q17RS7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GEN1Q17RS7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GEN1Q17RS7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GEN1Q17RS7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GEN1Q17RS7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GEN1Q17RS7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GEN1Q17RS7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GEN1Q17RS7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
GEN1Q17RS7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GEN1Q17RS7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GEN1Q17RS7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GEN1Q17RS7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
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