Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

Predictions only

Length 750 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC142Q17RM4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC142Q17RM4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC142Q17RM4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC142Q17RM4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC142Q17RM4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC142Q17RM4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC142Q17RM4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC142Q17RM4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC142Q17RM4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC142Q17RM4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC142Q17RM4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC142Q17RM4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC142Q17RM4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC142Q17RM4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC142Q17RM4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC142Q17RM4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC142Q17RM4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC142Q17RM4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC142Q17RM4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC142Q17RM4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC142Q17RM4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC142Q17RM4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC142Q17RM4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC142Q17RM4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC142Q17RM4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC142Q17RM4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC142Q17RM4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC142Q17RM4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC142Q17RM4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC142Q17RM4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC142Q17RM4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC142Q17RM4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC142Q17RM4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC142Q17RM4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC142Q17RM4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC142Q17RM4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC142Q17RM4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC142Q17RM4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC142Q17RM4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC142Q17RM4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC142Q17RM4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC142Q17RM4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC142Q17RM4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC142Q17RM4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC142Q17RM4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC142Q17RM4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC142Q17RM4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC142Q17RM4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC142Q17RM4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC142Q17RM4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC142Q17RM4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC142Q17RM4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC142Q17RM4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC142Q17RM4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC142Q17RM4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC142Q17RM4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC142Q17RM4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC142Q17RM4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC142Q17RM4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC142Q17RM4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC142Q17RM4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC142Q17RM4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC142Q17RM4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC142Q17RM4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC142Q17RM4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC142Q17RM4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC142Q17RM4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC142Q17RM4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC142Q17RM4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC142Q17RM4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC142Q17RM4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC142Q17RM4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC142Q17RM4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC142Q17RM4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC142Q17RM4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC142Q17RM4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC142Q17RM4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC142Q17RM4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC142Q17RM4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC142Q17RM4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC142Q17RM4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC142Q17RM4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC142Q17RM4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC142Q17RM4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC142Q17RM4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC142Q17RM4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC142Q17RM4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC142Q17RM4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC142Q17RM4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC142Q17RM4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC142Q17RM4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC142Q17RM4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC142Q17RM4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC142Q17RM4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC142Q17RM4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC142Q17RM4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC142Q17RM4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC142Q17RM4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC142Q17RM4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
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