Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ECM1Q16610 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
ECM1Q16610 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ECM1Q16610 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ECM1Q16610 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ECM1Q16610 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ECM1Q16610 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ECM1Q16610 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ECM1Q16610 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ECM1Q16610 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ECM1Q16610 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ECM1Q16610 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ECM1Q16610 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ECM1Q16610 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ECM1Q16610 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ECM1Q16610 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ECM1Q16610 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
ECM1Q16610 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ECM1Q16610 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ECM1Q16610 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
ECM1Q16610 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ECM1Q16610 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ECM1Q16610 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ECM1Q16610 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ECM1Q16610 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ECM1Q16610 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ECM1Q16610 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ECM1Q16610 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
ECM1Q16610 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ECM1Q16610 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ECM1Q16610 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ECM1Q16610 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ECM1Q16610 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ECM1Q16610 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ECM1Q16610 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ECM1Q16610 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
ECM1Q16610 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
ECM1Q16610 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ECM1Q16610 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ECM1Q16610 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ECM1Q16610 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ECM1Q16610 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ECM1Q16610 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ECM1Q16610 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ECM1Q16610 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ECM1Q16610 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ECM1Q16610 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ECM1Q16610 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ECM1Q16610 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ECM1Q16610 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ECM1Q16610 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ECM1Q16610 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ECM1Q16610 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
ECM1Q16610 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ECM1Q16610 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ECM1Q16610 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ECM1Q16610 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ECM1Q16610 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ECM1Q16610 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ECM1Q16610 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ECM1Q16610 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ECM1Q16610 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ECM1Q16610 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
ECM1Q16610 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ECM1Q16610 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ECM1Q16610 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ECM1Q16610 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ECM1Q16610 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ECM1Q16610 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ECM1Q16610 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
ECM1Q16610 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ECM1Q16610 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ECM1Q16610 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ECM1Q16610 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ECM1Q16610 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ECM1Q16610 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ECM1Q16610 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ECM1Q16610 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ECM1Q16610 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ECM1Q16610 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ECM1Q16610 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ECM1Q16610 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ECM1Q16610 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ECM1Q16610 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ECM1Q16610 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ECM1Q16610 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ECM1Q16610 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
ECM1Q16610 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
ECM1Q16610 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
ECM1Q16610 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ECM1Q16610 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ECM1Q16610 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ECM1Q16610 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ECM1Q16610 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ECM1Q16610 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ECM1Q16610 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ECM1Q16610 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ECM1Q16610 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ECM1Q16610 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ECM1Q16610 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms