Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FXNQ16595 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FXNQ16595 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FXNQ16595 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FXNQ16595 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FXNQ16595 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FXNQ16595 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FXNQ16595 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FXNQ16595 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FXNQ16595 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FXNQ16595 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FXNQ16595 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FXNQ16595 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FXNQ16595 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FXNQ16595 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FXNQ16595 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FXNQ16595 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FXNQ16595 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
FXNQ16595 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FXNQ16595 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FXNQ16595 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FXNQ16595 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FXNQ16595 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FXNQ16595 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FXNQ16595 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FXNQ16595 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FXNQ16595 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FXNQ16595 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FXNQ16595 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
FXNQ16595 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FXNQ16595 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FXNQ16595 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FXNQ16595 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FXNQ16595 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FXNQ16595 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FXNQ16595 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FXNQ16595 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FXNQ16595 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FXNQ16595 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FXNQ16595 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
FXNQ16595 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FXNQ16595 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FXNQ16595 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FXNQ16595 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FXNQ16595 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FXNQ16595 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FXNQ16595 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FXNQ16595 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FXNQ16595 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FXNQ16595 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FXNQ16595 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FXNQ16595 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
FXNQ16595 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FXNQ16595 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FXNQ16595 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FXNQ16595 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FXNQ16595 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FXNQ16595 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FXNQ16595 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FXNQ16595 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FXNQ16595 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FXNQ16595 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FXNQ16595 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FXNQ16595 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FXNQ16595 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FXNQ16595 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FXNQ16595 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
FXNQ16595 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
FXNQ16595 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FXNQ16595 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FXNQ16595 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FXNQ16595 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FXNQ16595 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FXNQ16595 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FXNQ16595 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FXNQ16595 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FXNQ16595 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FXNQ16595 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FXNQ16595 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FXNQ16595 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FXNQ16595 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FXNQ16595 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FXNQ16595 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FXNQ16595 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FXNQ16595 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FXNQ16595 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FXNQ16595 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FXNQ16595 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FXNQ16595 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FXNQ16595 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FXNQ16595 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FXNQ16595 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FXNQ16595 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FXNQ16595 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FXNQ16595 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FXNQ16595 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FXNQ16595 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
FXNQ16595 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FXNQ16595 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FXNQ16595 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms