Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY1Q16526 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CRY1Q16526 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CRY1Q16526 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CRY1Q16526 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CRY1Q16526 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CRY1Q16526 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CRY1Q16526 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CRY1Q16526 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CRY1Q16526 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CRY1Q16526 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CRY1Q16526 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CRY1Q16526 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CRY1Q16526 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CRY1Q16526 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CRY1Q16526 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CRY1Q16526 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CRY1Q16526 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CRY1Q16526 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CRY1Q16526 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CRY1Q16526 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CRY1Q16526 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CRY1Q16526 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CRY1Q16526 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CRY1Q16526 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CRY1Q16526 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CRY1Q16526 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CRY1Q16526 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CRY1Q16526 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CRY1Q16526 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CRY1Q16526 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CRY1Q16526 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CRY1Q16526 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CRY1Q16526 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CRY1Q16526 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CRY1Q16526 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CRY1Q16526 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CRY1Q16526 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CRY1Q16526 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CRY1Q16526 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CRY1Q16526 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CRY1Q16526 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CRY1Q16526 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CRY1Q16526 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CRY1Q16526 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CRY1Q16526 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CRY1Q16526 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CRY1Q16526 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CRY1Q16526 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CRY1Q16526 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CRY1Q16526 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CRY1Q16526 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CRY1Q16526 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CRY1Q16526 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CRY1Q16526 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CRY1Q16526 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CRY1Q16526 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CRY1Q16526 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CRY1Q16526 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CRY1Q16526 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CRY1Q16526 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CRY1Q16526 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CRY1Q16526 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CRY1Q16526 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CRY1Q16526 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CRY1Q16526 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CRY1Q16526 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CRY1Q16526 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CRY1Q16526 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CRY1Q16526 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CRY1Q16526 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CRY1Q16526 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CRY1Q16526 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CRY1Q16526 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CRY1Q16526 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CRY1Q16526 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRY1Q16526 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CRY1Q16526 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CRY1Q16526 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CRY1Q16526 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CRY1Q16526 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CRY1Q16526 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CRY1Q16526 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CRY1Q16526 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CRY1Q16526 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CRY1Q16526 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CRY1Q16526 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CRY1Q16526 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRY1Q16526 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRY1Q16526 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRY1Q16526 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRY1Q16526 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRY1Q16526 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRY1Q16526 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRY1Q16526 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRY1Q16526 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CRY1Q16526 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CRY1Q16526 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CRY1Q16526 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CRY1Q16526 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CRY1Q16526 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms