Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC6Q16204 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC6Q16204 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC6Q16204 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC6Q16204 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC6Q16204 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC6Q16204 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC6Q16204 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC6Q16204 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC6Q16204 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC6Q16204 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC6Q16204 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC6Q16204 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC6Q16204 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC6Q16204 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC6Q16204 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CCDC6Q16204 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC6Q16204 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC6Q16204 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC6Q16204 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC6Q16204 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC6Q16204 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC6Q16204 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC6Q16204 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC6Q16204 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC6Q16204 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC6Q16204 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC6Q16204 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC6Q16204 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC6Q16204 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC6Q16204 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC6Q16204 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC6Q16204 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC6Q16204 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC6Q16204 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC6Q16204 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC6Q16204 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC6Q16204 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC6Q16204 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC6Q16204 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC6Q16204 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC6Q16204 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC6Q16204 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC6Q16204 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC6Q16204 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC6Q16204 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC6Q16204 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC6Q16204 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC6Q16204 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC6Q16204 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC6Q16204 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC6Q16204 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC6Q16204 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC6Q16204 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC6Q16204 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC6Q16204 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC6Q16204 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC6Q16204 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC6Q16204 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC6Q16204 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC6Q16204 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC6Q16204 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC6Q16204 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC6Q16204 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC6Q16204 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC6Q16204 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC6Q16204 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC6Q16204 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC6Q16204 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC6Q16204 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC6Q16204 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC6Q16204 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC6Q16204 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC6Q16204 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC6Q16204 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC6Q16204 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC6Q16204 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC6Q16204 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC6Q16204 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC6Q16204 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC6Q16204 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC6Q16204 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC6Q16204 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC6Q16204 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC6Q16204 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC6Q16204 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC6Q16204 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC6Q16204 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC6Q16204 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC6Q16204 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC6Q16204 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC6Q16204 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC6Q16204 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC6Q16204 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC6Q16204 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC6Q16204 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC6Q16204 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC6Q16204 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC6Q16204 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC6Q16204 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
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