Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMGN3Q15651 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMGN3Q15651 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMGN3Q15651 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMGN3Q15651 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMGN3Q15651 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMGN3Q15651 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HMGN3Q15651 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMGN3Q15651 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMGN3Q15651 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMGN3Q15651 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMGN3Q15651 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMGN3Q15651 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMGN3Q15651 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMGN3Q15651 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMGN3Q15651 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMGN3Q15651 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMGN3Q15651 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMGN3Q15651 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMGN3Q15651 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMGN3Q15651 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMGN3Q15651 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMGN3Q15651 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMGN3Q15651 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMGN3Q15651 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMGN3Q15651 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMGN3Q15651 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMGN3Q15651 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMGN3Q15651 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HMGN3Q15651 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HMGN3Q15651 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HMGN3Q15651 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HMGN3Q15651 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMGN3Q15651 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMGN3Q15651 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMGN3Q15651 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMGN3Q15651 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMGN3Q15651 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMGN3Q15651 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMGN3Q15651 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMGN3Q15651 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HMGN3Q15651 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMGN3Q15651 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMGN3Q15651 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMGN3Q15651 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMGN3Q15651 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMGN3Q15651 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMGN3Q15651 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMGN3Q15651 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMGN3Q15651 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMGN3Q15651 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMGN3Q15651 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMGN3Q15651 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMGN3Q15651 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMGN3Q15651 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMGN3Q15651 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HMGN3Q15651 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HMGN3Q15651 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HMGN3Q15651 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HMGN3Q15651 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HMGN3Q15651 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HMGN3Q15651 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HMGN3Q15651 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HMGN3Q15651 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HMGN3Q15651 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HMGN3Q15651 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HMGN3Q15651 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HMGN3Q15651 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
HMGN3Q15651 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HMGN3Q15651 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HMGN3Q15651 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HMGN3Q15651 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HMGN3Q15651 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HMGN3Q15651 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HMGN3Q15651 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HMGN3Q15651 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HMGN3Q15651 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HMGN3Q15651 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HMGN3Q15651 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HMGN3Q15651 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HMGN3Q15651 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HMGN3Q15651 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HMGN3Q15651 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HMGN3Q15651 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HMGN3Q15651 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HMGN3Q15651 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HMGN3Q15651 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HMGN3Q15651 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HMGN3Q15651 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HMGN3Q15651 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HMGN3Q15651 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HMGN3Q15651 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HMGN3Q15651 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HMGN3Q15651 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HMGN3Q15651 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HMGN3Q15651 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HMGN3Q15651 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HMGN3Q15651 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HMGN3Q15651 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HMGN3Q15651 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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