Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SNX17Q15036 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SNX17Q15036 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SNX17Q15036 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SNX17Q15036 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SNX17Q15036 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SNX17Q15036 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SNX17Q15036 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SNX17Q15036 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SNX17Q15036 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SNX17Q15036 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
SNX17Q15036 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SNX17Q15036 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SNX17Q15036 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SNX17Q15036 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
SNX17Q15036 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SNX17Q15036 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SNX17Q15036 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SNX17Q15036 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SNX17Q15036 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SNX17Q15036 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SNX17Q15036 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SNX17Q15036 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SNX17Q15036 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SNX17Q15036 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SNX17Q15036 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SNX17Q15036 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SNX17Q15036 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SNX17Q15036 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SNX17Q15036 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SNX17Q15036 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SNX17Q15036 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SNX17Q15036 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SNX17Q15036 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SNX17Q15036 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SNX17Q15036 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SNX17Q15036 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SNX17Q15036 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SNX17Q15036 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SNX17Q15036 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SNX17Q15036 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SNX17Q15036 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SNX17Q15036 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SNX17Q15036 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SNX17Q15036 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SNX17Q15036 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SNX17Q15036 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SNX17Q15036 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SNX17Q15036 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SNX17Q15036 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SNX17Q15036 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SNX17Q15036 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SNX17Q15036 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SNX17Q15036 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SNX17Q15036 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SNX17Q15036 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SNX17Q15036 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SNX17Q15036 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SNX17Q15036 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SNX17Q15036 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SNX17Q15036 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SNX17Q15036 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SNX17Q15036 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SNX17Q15036 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SNX17Q15036 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SNX17Q15036 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SNX17Q15036 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SNX17Q15036 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SNX17Q15036 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SNX17Q15036 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SNX17Q15036 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SNX17Q15036 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SNX17Q15036 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
SNX17Q15036 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SNX17Q15036 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SNX17Q15036 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SNX17Q15036 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SNX17Q15036 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SNX17Q15036 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SNX17Q15036 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SNX17Q15036 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
SNX17Q15036 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SNX17Q15036 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SNX17Q15036 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SNX17Q15036 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SNX17Q15036 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SNX17Q15036 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SNX17Q15036 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
SNX17Q15036 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SNX17Q15036 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SNX17Q15036 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
SNX17Q15036 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SNX17Q15036 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
SNX17Q15036 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SNX17Q15036 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
SNX17Q15036 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SNX17Q15036 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SNX17Q15036 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SNX17Q15036 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
SNX17Q15036 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 581.7 ms