Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PSMD6Q15008 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PSMD6Q15008 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PSMD6Q15008 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PSMD6Q15008 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PSMD6Q15008 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PSMD6Q15008 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PSMD6Q15008 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PSMD6Q15008 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PSMD6Q15008 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PSMD6Q15008 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PSMD6Q15008 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PSMD6Q15008 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PSMD6Q15008 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PSMD6Q15008 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PSMD6Q15008 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PSMD6Q15008 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PSMD6Q15008 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PSMD6Q15008 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PSMD6Q15008 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSMD6Q15008 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSMD6Q15008 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSMD6Q15008 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PSMD6Q15008 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSMD6Q15008 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSMD6Q15008 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSMD6Q15008 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PSMD6Q15008 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PSMD6Q15008 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PSMD6Q15008 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PSMD6Q15008 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PSMD6Q15008 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PSMD6Q15008 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PSMD6Q15008 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PSMD6Q15008 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PSMD6Q15008 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PSMD6Q15008 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PSMD6Q15008 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PSMD6Q15008 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PSMD6Q15008 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PSMD6Q15008 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PSMD6Q15008 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PSMD6Q15008 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PSMD6Q15008 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PSMD6Q15008 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PSMD6Q15008 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PSMD6Q15008 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PSMD6Q15008 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PSMD6Q15008 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PSMD6Q15008 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PSMD6Q15008 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PSMD6Q15008 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PSMD6Q15008 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PSMD6Q15008 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PSMD6Q15008 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PSMD6Q15008 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PSMD6Q15008 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PSMD6Q15008 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PSMD6Q15008 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PSMD6Q15008 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PSMD6Q15008 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PSMD6Q15008 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PSMD6Q15008 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PSMD6Q15008 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PSMD6Q15008 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PSMD6Q15008 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PSMD6Q15008 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PSMD6Q15008 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PSMD6Q15008 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PSMD6Q15008 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PSMD6Q15008 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PSMD6Q15008 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PSMD6Q15008 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PSMD6Q15008 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PSMD6Q15008 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PSMD6Q15008 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PSMD6Q15008 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PSMD6Q15008 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PSMD6Q15008 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PSMD6Q15008 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PSMD6Q15008 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PSMD6Q15008 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
PSMD6Q15008 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSMD6Q15008 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSMD6Q15008 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSMD6Q15008 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSMD6Q15008 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PSMD6Q15008 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PSMD6Q15008 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PSMD6Q15008 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PSMD6Q15008 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PSMD6Q15008 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PSMD6Q15008 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PSMD6Q15008 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PSMD6Q15008 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PSMD6Q15008 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PSMD6Q15008 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PSMD6Q15008 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PSMD6Q15008 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PSMD6Q15008 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms