Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CTTNQ14247 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CTTNQ14247 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CTTNQ14247 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CTTNQ14247 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CTTNQ14247 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CTTNQ14247 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CTTNQ14247 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CTTNQ14247 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CTTNQ14247 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CTTNQ14247 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CTTNQ14247 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CTTNQ14247 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CTTNQ14247 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CTTNQ14247 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CTTNQ14247 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CTTNQ14247 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CTTNQ14247 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CTTNQ14247 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CTTNQ14247 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CTTNQ14247 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CTTNQ14247 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CTTNQ14247 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
CTTNQ14247 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CTTNQ14247 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CTTNQ14247 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CTTNQ14247 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CTTNQ14247 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CTTNQ14247 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CTTNQ14247 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CTTNQ14247 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CTTNQ14247 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CTTNQ14247 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CTTNQ14247 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CTTNQ14247 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CTTNQ14247 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CTTNQ14247 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CTTNQ14247 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CTTNQ14247 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CTTNQ14247 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CTTNQ14247 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CTTNQ14247 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CTTNQ14247 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CTTNQ14247 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CTTNQ14247 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CTTNQ14247 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CTTNQ14247 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CTTNQ14247 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CTTNQ14247 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CTTNQ14247 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CTTNQ14247 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CTTNQ14247 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CTTNQ14247 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CTTNQ14247 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CTTNQ14247 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CTTNQ14247 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CTTNQ14247 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CTTNQ14247 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CTTNQ14247 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CTTNQ14247 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CTTNQ14247 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CTTNQ14247 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CTTNQ14247 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CTTNQ14247 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CTTNQ14247 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CTTNQ14247 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CTTNQ14247 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CTTNQ14247 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CTTNQ14247 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CTTNQ14247 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CTTNQ14247 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CTTNQ14247 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CTTNQ14247 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CTTNQ14247 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CTTNQ14247 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CTTNQ14247 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CTTNQ14247 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CTTNQ14247 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CTTNQ14247 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CTTNQ14247 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CTTNQ14247 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CTTNQ14247 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CTTNQ14247 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CTTNQ14247 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CTTNQ14247 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CTTNQ14247 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CTTNQ14247 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CTTNQ14247 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CTTNQ14247 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CTTNQ14247 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CTTNQ14247 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CTTNQ14247 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CTTNQ14247 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CTTNQ14247 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CTTNQ14247 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CTTNQ14247 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CTTNQ14247 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CTTNQ14247 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CTTNQ14247 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CTTNQ14247 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
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