Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLF9Q13886 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLF9Q13886 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
KLF9Q13886 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLF9Q13886 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLF9Q13886 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLF9Q13886 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
KLF9Q13886 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
KLF9Q13886 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLF9Q13886 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLF9Q13886 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLF9Q13886 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLF9Q13886 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLF9Q13886 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLF9Q13886 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLF9Q13886 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLF9Q13886 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLF9Q13886 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLF9Q13886 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLF9Q13886 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLF9Q13886 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLF9Q13886 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLF9Q13886 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLF9Q13886 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLF9Q13886 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLF9Q13886 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLF9Q13886 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLF9Q13886 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLF9Q13886 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
KLF9Q13886 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLF9Q13886 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLF9Q13886 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLF9Q13886 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLF9Q13886 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLF9Q13886 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLF9Q13886 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
KLF9Q13886 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLF9Q13886 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLF9Q13886 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLF9Q13886 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
KLF9Q13886 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLF9Q13886 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLF9Q13886 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLF9Q13886 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLF9Q13886 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLF9Q13886 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLF9Q13886 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLF9Q13886 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLF9Q13886 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLF9Q13886 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLF9Q13886 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLF9Q13886 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLF9Q13886 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLF9Q13886 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLF9Q13886 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLF9Q13886 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLF9Q13886 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLF9Q13886 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLF9Q13886 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLF9Q13886 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLF9Q13886 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLF9Q13886 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLF9Q13886 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLF9Q13886 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
KLF9Q13886 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLF9Q13886 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
KLF9Q13886 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLF9Q13886 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLF9Q13886 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLF9Q13886 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLF9Q13886 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLF9Q13886 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLF9Q13886 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
KLF9Q13886 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
KLF9Q13886 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLF9Q13886 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLF9Q13886 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
KLF9Q13886 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLF9Q13886 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLF9Q13886 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
KLF9Q13886 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLF9Q13886 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLF9Q13886 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLF9Q13886 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLF9Q13886 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLF9Q13886 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLF9Q13886 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
KLF9Q13886 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLF9Q13886 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLF9Q13886 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLF9Q13886 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLF9Q13886 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLF9Q13886 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLF9Q13886 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLF9Q13886 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLF9Q13886 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLF9Q13886 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLF9Q13886 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLF9Q13886 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLF9Q13886 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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