Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMAD4Q13485 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMAD4Q13485 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SMAD4Q13485 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMAD4Q13485 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SMAD4Q13485 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMAD4Q13485 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMAD4Q13485 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMAD4Q13485 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMAD4Q13485 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMAD4Q13485 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMAD4Q13485 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMAD4Q13485 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMAD4Q13485 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMAD4Q13485 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMAD4Q13485 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMAD4Q13485 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMAD4Q13485 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMAD4Q13485 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMAD4Q13485 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMAD4Q13485 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SMAD4Q13485 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SMAD4Q13485 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMAD4Q13485 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMAD4Q13485 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMAD4Q13485 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SMAD4Q13485 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMAD4Q13485 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMAD4Q13485 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMAD4Q13485 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMAD4Q13485 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMAD4Q13485 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMAD4Q13485 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMAD4Q13485 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMAD4Q13485 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMAD4Q13485 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMAD4Q13485 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMAD4Q13485 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMAD4Q13485 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMAD4Q13485 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SMAD4Q13485 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMAD4Q13485 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMAD4Q13485 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMAD4Q13485 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMAD4Q13485 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMAD4Q13485 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SMAD4Q13485 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMAD4Q13485 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SMAD4Q13485 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMAD4Q13485 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMAD4Q13485 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMAD4Q13485 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SMAD4Q13485 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMAD4Q13485 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SMAD4Q13485 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMAD4Q13485 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SMAD4Q13485 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SMAD4Q13485 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMAD4Q13485 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SMAD4Q13485 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMAD4Q13485 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMAD4Q13485 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMAD4Q13485 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMAD4Q13485 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMAD4Q13485 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SMAD4Q13485 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMAD4Q13485 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMAD4Q13485 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMAD4Q13485 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMAD4Q13485 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMAD4Q13485 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMAD4Q13485 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMAD4Q13485 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMAD4Q13485 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMAD4Q13485 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMAD4Q13485 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMAD4Q13485 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMAD4Q13485 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMAD4Q13485 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMAD4Q13485 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMAD4Q13485 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMAD4Q13485 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMAD4Q13485 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMAD4Q13485 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMAD4Q13485 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SMAD4Q13485 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMAD4Q13485 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SMAD4Q13485 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMAD4Q13485 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMAD4Q13485 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMAD4Q13485 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SMAD4Q13485 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SMAD4Q13485 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMAD4Q13485 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMAD4Q13485 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMAD4Q13485 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMAD4Q13485 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMAD4Q13485 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMAD4Q13485 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMAD4Q13485 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
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