Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RESTQ13127 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RESTQ13127 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RESTQ13127 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RESTQ13127 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RESTQ13127 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RESTQ13127 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
RESTQ13127 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RESTQ13127 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
RESTQ13127 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RESTQ13127 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RESTQ13127 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RESTQ13127 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
RESTQ13127 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RESTQ13127 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RESTQ13127 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RESTQ13127 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RESTQ13127 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RESTQ13127 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RESTQ13127 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RESTQ13127 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RESTQ13127 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RESTQ13127 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RESTQ13127 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
RESTQ13127 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RESTQ13127 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RESTQ13127 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RESTQ13127 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
RESTQ13127 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RESTQ13127 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RESTQ13127 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RESTQ13127 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RESTQ13127 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RESTQ13127 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RESTQ13127 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RESTQ13127 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RESTQ13127 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RESTQ13127 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RESTQ13127 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RESTQ13127 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RESTQ13127 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RESTQ13127 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
RESTQ13127 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RESTQ13127 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RESTQ13127 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RESTQ13127 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RESTQ13127 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RESTQ13127 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RESTQ13127 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RESTQ13127 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
RESTQ13127 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RESTQ13127 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RESTQ13127 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RESTQ13127 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RESTQ13127 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RESTQ13127 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RESTQ13127 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
RESTQ13127 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
RESTQ13127 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RESTQ13127 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RESTQ13127 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RESTQ13127 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RESTQ13127 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RESTQ13127 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RESTQ13127 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RESTQ13127 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RESTQ13127 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RESTQ13127 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RESTQ13127 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
RESTQ13127 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RESTQ13127 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RESTQ13127 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RESTQ13127 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
RESTQ13127 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RESTQ13127 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RESTQ13127 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RESTQ13127 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RESTQ13127 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RESTQ13127 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RESTQ13127 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RESTQ13127 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RESTQ13127 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RESTQ13127 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RESTQ13127 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
RESTQ13127 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
RESTQ13127 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
RESTQ13127 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RESTQ13127 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RESTQ13127 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RESTQ13127 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RESTQ13127 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RESTQ13127 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RESTQ13127 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RESTQ13127 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RESTQ13127 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RESTQ13127 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RESTQ13127 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RESTQ13127 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RESTQ13127 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RESTQ13127 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
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