Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TRDNQ13061 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TRDNQ13061 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TRDNQ13061 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TRDNQ13061 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TRDNQ13061 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TRDNQ13061 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
TRDNQ13061 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
TRDNQ13061 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
TRDNQ13061 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TRDNQ13061 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
TRDNQ13061 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TRDNQ13061 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
TRDNQ13061 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TRDNQ13061 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TRDNQ13061 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TRDNQ13061 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
TRDNQ13061 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TRDNQ13061 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
TRDNQ13061 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TRDNQ13061 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TRDNQ13061 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
TRDNQ13061 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TRDNQ13061 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TRDNQ13061 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
TRDNQ13061 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
TRDNQ13061 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
TRDNQ13061 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
TRDNQ13061 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
TRDNQ13061 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TRDNQ13061 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TRDNQ13061 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TRDNQ13061 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TRDNQ13061 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TRDNQ13061 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TRDNQ13061 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TRDNQ13061 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TRDNQ13061 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TRDNQ13061 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TRDNQ13061 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TRDNQ13061 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TRDNQ13061 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TRDNQ13061 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TRDNQ13061 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TRDNQ13061 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TRDNQ13061 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
TRDNQ13061 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TRDNQ13061 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TRDNQ13061 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
TRDNQ13061 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TRDNQ13061 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TRDNQ13061 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TRDNQ13061 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
TRDNQ13061 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
TRDNQ13061 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TRDNQ13061 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TRDNQ13061 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TRDNQ13061 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TRDNQ13061 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TRDNQ13061 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TRDNQ13061 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
TRDNQ13061 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
TRDNQ13061 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
TRDNQ13061 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
TRDNQ13061 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TRDNQ13061 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
TRDNQ13061 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
TRDNQ13061 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
TRDNQ13061 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
TRDNQ13061 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
TRDNQ13061 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
TRDNQ13061 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TRDNQ13061 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TRDNQ13061 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TRDNQ13061 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TRDNQ13061 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TRDNQ13061 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TRDNQ13061 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TRDNQ13061 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TRDNQ13061 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TRDNQ13061 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TRDNQ13061 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TRDNQ13061 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TRDNQ13061 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
TRDNQ13061 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
TRDNQ13061 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
TRDNQ13061 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TRDNQ13061 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TRDNQ13061 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TRDNQ13061 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
TRDNQ13061 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TRDNQ13061 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TRDNQ13061 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TRDNQ13061 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TRDNQ13061 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TRDNQ13061 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TRDNQ13061 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TRDNQ13061 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TRDNQ13061 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TRDNQ13061 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
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