Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
STRN3Q13033 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
STRN3Q13033 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
STRN3Q13033 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
STRN3Q13033 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
STRN3Q13033 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
STRN3Q13033 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
STRN3Q13033 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
STRN3Q13033 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
STRN3Q13033 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
STRN3Q13033 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
STRN3Q13033 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
STRN3Q13033 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
STRN3Q13033 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
STRN3Q13033 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
STRN3Q13033 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
STRN3Q13033 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
STRN3Q13033 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
STRN3Q13033 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
STRN3Q13033 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
STRN3Q13033 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
STRN3Q13033 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
STRN3Q13033 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
STRN3Q13033 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
STRN3Q13033 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
STRN3Q13033 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
STRN3Q13033 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
STRN3Q13033 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
STRN3Q13033 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
STRN3Q13033 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
STRN3Q13033 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
STRN3Q13033 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
STRN3Q13033 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
STRN3Q13033 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
STRN3Q13033 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
STRN3Q13033 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
STRN3Q13033 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
STRN3Q13033 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
STRN3Q13033 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
STRN3Q13033 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
STRN3Q13033 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
STRN3Q13033 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
STRN3Q13033 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
STRN3Q13033 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
STRN3Q13033 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
STRN3Q13033 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
STRN3Q13033 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
STRN3Q13033 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
STRN3Q13033 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
STRN3Q13033 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
STRN3Q13033 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
STRN3Q13033 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
STRN3Q13033 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
STRN3Q13033 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
STRN3Q13033 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
STRN3Q13033 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
STRN3Q13033 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
STRN3Q13033 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
STRN3Q13033 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
STRN3Q13033 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
STRN3Q13033 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
STRN3Q13033 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
STRN3Q13033 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
STRN3Q13033 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
STRN3Q13033 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
STRN3Q13033 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
STRN3Q13033 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
STRN3Q13033 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
STRN3Q13033 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
STRN3Q13033 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
STRN3Q13033 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
STRN3Q13033 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
STRN3Q13033 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
STRN3Q13033 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
STRN3Q13033 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
STRN3Q13033 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
STRN3Q13033 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
STRN3Q13033 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
STRN3Q13033 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
STRN3Q13033 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
STRN3Q13033 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
STRN3Q13033 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
STRN3Q13033 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
STRN3Q13033 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
STRN3Q13033 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
STRN3Q13033 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
STRN3Q13033 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
STRN3Q13033 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
STRN3Q13033 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
STRN3Q13033 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
STRN3Q13033 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
STRN3Q13033 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
STRN3Q13033 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
STRN3Q13033 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
STRN3Q13033 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
STRN3Q13033 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
STRN3Q13033 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
STRN3Q13033 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
STRN3Q13033 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
STRN3Q13033 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
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