Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
TFCP2Q12800 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
TFCP2Q12800 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
TFCP2Q12800 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
TFCP2Q12800 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
TFCP2Q12800 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
TFCP2Q12800 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
TFCP2Q12800 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
TFCP2Q12800 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
TFCP2Q12800 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
TFCP2Q12800 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
TFCP2Q12800 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
TFCP2Q12800 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TFCP2Q12800 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TFCP2Q12800 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
TFCP2Q12800 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TFCP2Q12800 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TFCP2Q12800 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC31.74■■■□□ 2.67
TFCP2Q12800 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
TFCP2Q12800 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
TFCP2Q12800 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
TFCP2Q12800 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
TFCP2Q12800 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
TFCP2Q12800 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TFCP2Q12800 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
TFCP2Q12800 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TFCP2Q12800 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TFCP2Q12800 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.7■■■□□ 2.66
TFCP2Q12800 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
TFCP2Q12800 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
TFCP2Q12800 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
TFCP2Q12800 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TFCP2Q12800 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TFCP2Q12800 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TFCP2Q12800 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TFCP2Q12800 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TFCP2Q12800 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TFCP2Q12800 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
TFCP2Q12800 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
TFCP2Q12800 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
TFCP2Q12800 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
TFCP2Q12800 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
TFCP2Q12800 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
TFCP2Q12800 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
TFCP2Q12800 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
TFCP2Q12800 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
TFCP2Q12800 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
TFCP2Q12800 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
TFCP2Q12800 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
TFCP2Q12800 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TFCP2Q12800 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TFCP2Q12800 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
TFCP2Q12800 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TFCP2Q12800 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
TFCP2Q12800 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
TFCP2Q12800 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TFCP2Q12800 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TFCP2Q12800 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
TFCP2Q12800 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TFCP2Q12800 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TFCP2Q12800 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
TFCP2Q12800 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
TFCP2Q12800 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
TFCP2Q12800 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
TFCP2Q12800 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
TFCP2Q12800 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
TFCP2Q12800 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TFCP2Q12800 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
TFCP2Q12800 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
TFCP2Q12800 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
TFCP2Q12800 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
TFCP2Q12800 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
TFCP2Q12800 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
TFCP2Q12800 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
TFCP2Q12800 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TFCP2Q12800 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TFCP2Q12800 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
TFCP2Q12800 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
TFCP2Q12800 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
TFCP2Q12800 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
TFCP2Q12800 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
TFCP2Q12800 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
TFCP2Q12800 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
TFCP2Q12800 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
TFCP2Q12800 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
TFCP2Q12800 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
TFCP2Q12800 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
TFCP2Q12800 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
TFCP2Q12800 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
TFCP2Q12800 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
TFCP2Q12800 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
TFCP2Q12800 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC31.49■■■□□ 2.63
TFCP2Q12800 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TFCP2Q12800 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TFCP2Q12800 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
TFCP2Q12800 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
TFCP2Q12800 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
TFCP2Q12800 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
TFCP2Q12800 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
TFCP2Q12800 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms