Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPOCK1Q08629 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SPOCK1Q08629 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPOCK1Q08629 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPOCK1Q08629 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPOCK1Q08629 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPOCK1Q08629 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPOCK1Q08629 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPOCK1Q08629 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPOCK1Q08629 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPOCK1Q08629 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPOCK1Q08629 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPOCK1Q08629 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPOCK1Q08629 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPOCK1Q08629 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SPOCK1Q08629 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SPOCK1Q08629 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPOCK1Q08629 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPOCK1Q08629 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPOCK1Q08629 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SPOCK1Q08629 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPOCK1Q08629 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPOCK1Q08629 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPOCK1Q08629 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPOCK1Q08629 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPOCK1Q08629 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPOCK1Q08629 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPOCK1Q08629 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPOCK1Q08629 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPOCK1Q08629 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPOCK1Q08629 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPOCK1Q08629 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPOCK1Q08629 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPOCK1Q08629 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPOCK1Q08629 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SPOCK1Q08629 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPOCK1Q08629 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPOCK1Q08629 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPOCK1Q08629 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPOCK1Q08629 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPOCK1Q08629 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPOCK1Q08629 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPOCK1Q08629 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPOCK1Q08629 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPOCK1Q08629 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPOCK1Q08629 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPOCK1Q08629 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPOCK1Q08629 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPOCK1Q08629 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPOCK1Q08629 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPOCK1Q08629 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPOCK1Q08629 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPOCK1Q08629 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPOCK1Q08629 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPOCK1Q08629 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPOCK1Q08629 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPOCK1Q08629 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPOCK1Q08629 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPOCK1Q08629 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPOCK1Q08629 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SPOCK1Q08629 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SPOCK1Q08629 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPOCK1Q08629 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPOCK1Q08629 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPOCK1Q08629 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPOCK1Q08629 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPOCK1Q08629 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPOCK1Q08629 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SPOCK1Q08629 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SPOCK1Q08629 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SPOCK1Q08629 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPOCK1Q08629 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPOCK1Q08629 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPOCK1Q08629 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPOCK1Q08629 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPOCK1Q08629 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPOCK1Q08629 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPOCK1Q08629 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPOCK1Q08629 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPOCK1Q08629 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPOCK1Q08629 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPOCK1Q08629 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPOCK1Q08629 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPOCK1Q08629 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPOCK1Q08629 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPOCK1Q08629 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPOCK1Q08629 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPOCK1Q08629 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPOCK1Q08629 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPOCK1Q08629 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPOCK1Q08629 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPOCK1Q08629 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPOCK1Q08629 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPOCK1Q08629 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPOCK1Q08629 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SPOCK1Q08629 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPOCK1Q08629 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPOCK1Q08629 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPOCK1Q08629 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SPOCK1Q08629 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms