Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
EXOSC9Q06265 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
EXOSC9Q06265 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
EXOSC9Q06265 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
EXOSC9Q06265 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
EXOSC9Q06265 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
EXOSC9Q06265 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.32■■■□□ 2.92
EXOSC9Q06265 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
EXOSC9Q06265 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
EXOSC9Q06265 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
EXOSC9Q06265 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
EXOSC9Q06265 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
EXOSC9Q06265 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC33.31■■■□□ 2.92
EXOSC9Q06265 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
EXOSC9Q06265 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
EXOSC9Q06265 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
EXOSC9Q06265 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC33.29■■■□□ 2.92
EXOSC9Q06265 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
EXOSC9Q06265 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
EXOSC9Q06265 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
EXOSC9Q06265 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
EXOSC9Q06265 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
EXOSC9Q06265 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
EXOSC9Q06265 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
EXOSC9Q06265 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
EXOSC9Q06265 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
EXOSC9Q06265 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
EXOSC9Q06265 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
EXOSC9Q06265 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
EXOSC9Q06265 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
EXOSC9Q06265 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
EXOSC9Q06265 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
EXOSC9Q06265 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
EXOSC9Q06265 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
EXOSC9Q06265 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
EXOSC9Q06265 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC33.22■■■□□ 2.91
EXOSC9Q06265 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
EXOSC9Q06265 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
EXOSC9Q06265 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
EXOSC9Q06265 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
EXOSC9Q06265 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
EXOSC9Q06265 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
EXOSC9Q06265 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
EXOSC9Q06265 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
EXOSC9Q06265 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
EXOSC9Q06265 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
EXOSC9Q06265 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
EXOSC9Q06265 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
EXOSC9Q06265 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
EXOSC9Q06265 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
EXOSC9Q06265 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
EXOSC9Q06265 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
EXOSC9Q06265 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
EXOSC9Q06265 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
EXOSC9Q06265 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
EXOSC9Q06265 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
EXOSC9Q06265 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
EXOSC9Q06265 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
EXOSC9Q06265 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
EXOSC9Q06265 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
EXOSC9Q06265 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
EXOSC9Q06265 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
EXOSC9Q06265 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
EXOSC9Q06265 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
EXOSC9Q06265 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
EXOSC9Q06265 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
EXOSC9Q06265 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
EXOSC9Q06265 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
EXOSC9Q06265 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
EXOSC9Q06265 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
EXOSC9Q06265 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
EXOSC9Q06265 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
EXOSC9Q06265 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
EXOSC9Q06265 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
EXOSC9Q06265 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
EXOSC9Q06265 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
EXOSC9Q06265 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
EXOSC9Q06265 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
EXOSC9Q06265 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
EXOSC9Q06265 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
EXOSC9Q06265 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
EXOSC9Q06265 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
EXOSC9Q06265 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
EXOSC9Q06265 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC33.07■■■□□ 2.88
EXOSC9Q06265 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
EXOSC9Q06265 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
EXOSC9Q06265 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
EXOSC9Q06265 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
EXOSC9Q06265 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
EXOSC9Q06265 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
EXOSC9Q06265 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
EXOSC9Q06265 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
EXOSC9Q06265 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
EXOSC9Q06265 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
EXOSC9Q06265 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
EXOSC9Q06265 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
EXOSC9Q06265 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
EXOSC9Q06265 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
EXOSC9Q06265 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
EXOSC9Q06265 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms