Protein–RNA interactions for Protein: Q05048

CSTF1, Cleavage stimulation factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF1Q05048 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CSTF1Q05048 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CSTF1Q05048 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CSTF1Q05048 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CSTF1Q05048 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CSTF1Q05048 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CSTF1Q05048 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CSTF1Q05048 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CSTF1Q05048 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CSTF1Q05048 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CSTF1Q05048 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CSTF1Q05048 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CSTF1Q05048 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CSTF1Q05048 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CSTF1Q05048 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CSTF1Q05048 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CSTF1Q05048 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CSTF1Q05048 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CSTF1Q05048 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CSTF1Q05048 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CSTF1Q05048 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CSTF1Q05048 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CSTF1Q05048 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CSTF1Q05048 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CSTF1Q05048 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CSTF1Q05048 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CSTF1Q05048 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CSTF1Q05048 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CSTF1Q05048 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CSTF1Q05048 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CSTF1Q05048 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CSTF1Q05048 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CSTF1Q05048 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CSTF1Q05048 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CSTF1Q05048 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CSTF1Q05048 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CSTF1Q05048 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CSTF1Q05048 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CSTF1Q05048 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CSTF1Q05048 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CSTF1Q05048 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CSTF1Q05048 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CSTF1Q05048 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CSTF1Q05048 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CSTF1Q05048 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CSTF1Q05048 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CSTF1Q05048 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CSTF1Q05048 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CSTF1Q05048 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CSTF1Q05048 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CSTF1Q05048 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CSTF1Q05048 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CSTF1Q05048 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CSTF1Q05048 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CSTF1Q05048 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CSTF1Q05048 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CSTF1Q05048 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CSTF1Q05048 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CSTF1Q05048 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CSTF1Q05048 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CSTF1Q05048 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CSTF1Q05048 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CSTF1Q05048 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CSTF1Q05048 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CSTF1Q05048 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CSTF1Q05048 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CSTF1Q05048 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CSTF1Q05048 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CSTF1Q05048 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CSTF1Q05048 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CSTF1Q05048 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CSTF1Q05048 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CSTF1Q05048 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CSTF1Q05048 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CSTF1Q05048 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CSTF1Q05048 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CSTF1Q05048 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CSTF1Q05048 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CSTF1Q05048 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CSTF1Q05048 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CSTF1Q05048 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CSTF1Q05048 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CSTF1Q05048 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CSTF1Q05048 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CSTF1Q05048 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CSTF1Q05048 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CSTF1Q05048 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CSTF1Q05048 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CSTF1Q05048 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CSTF1Q05048 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CSTF1Q05048 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CSTF1Q05048 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CSTF1Q05048 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CSTF1Q05048 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CSTF1Q05048 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CSTF1Q05048 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CSTF1Q05048 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CSTF1Q05048 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CSTF1Q05048 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CSTF1Q05048 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms